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LA SYSTÉMATIQUE I. Introduction ▪ La systématique Méthode de classification biologique des êtres vivants. (Initialement fondée sur des critères morphologiques [classification de Linné], la systématique s'est ensuite appliquée à prendre en compte l'évolution des espèces [systématique phylogén...

LA SYSTÉMATIQUE I. Introduction ▪ La systématique Méthode de classification biologique des êtres vivants. (Initialement fondée sur des critères morphologiques [classification de Linné], la systématique s'est ensuite appliquée à prendre en compte l'évolution des espèces [systématique phylogénique] et, de plus en plus, à les regrouper sur la base de caractères spécifiques (génétique ou moléculaire) ▪ Classification classique Établie par Carl Von Linné (1707-1778) basée sur les ressemblances morphologiques. Elle divise le monde vivant en deux types de catégories: Les taxons et les rangs de taxons. Les taxons sont les noms des groupes d’espèces formés par la classification (vertébrés, crustacés, mollusques etc) Les rangs de taxon sont le niveau hiérarchique que chaque taxon occupe dans la classification (genre, famille, ordre etc). Dans de nombreux cas, le critère est la présence d'un caractère, s'opposant à son absence (ex: vertébrés-Invertébrés). ▪ Classification phylogénétique: Est l’étude des liens de parenté entre les êtres vivant. Elle permet de reconstituer l’évolution des organismes vivants. Les êtres vivants sont classés par groupes hiérarchisés du plus particulier qui est l'espèce au plus général qui le règne. La base de l'ordre hiérarchique de classification des êtres vivants est l'espèce tandis que le plus haut niveau est le règne. On distingue dans l'ordre croissant : l'espèce – le genre - la famille – l'ordre – la classe – l'embranchement – le règne. L'espèce est l'unité de base de la classification. L'espèce désigne un ensemble d'individus vivant sur un même territoire, ayant les mêmes caractères morphologiques (ressemblance), les mêmes caractères physiologiques et le même mode de vie, qui sont interféconds (se reproduisant entre eux et de donner des descendants fertiles L’espèce peut être divisée en sous espèces (races s’il d’agit d’un animal, variétés s’il s’agit d’une plante) qui sont en général des variations géographiques d’une même forme. Un certain nombre d’espèces possédant en commun suffisamment d’affinités pour former un groupe distinct : le genre. Les genres par le même procédé sont regroupés en famille ; les familles en ordre, les ordres en classe, les classes en embranchement. La totalité des embranchements constituent le règne Des classifications plus précises font intervenir des catégories intermédiaires, exemple: sous- embranchement, superclasse, superfamille II. La nomenclature binominale Cette nomenclature correspond au nom scientifique d'une espèce. Ce nom est formé de deux mots latins et il s'écrit en italique. Le premier mot commence par une lettre majuscule et désigne le genre de l'espèce. Le genre regroupe toutes les espèces qui ont un lien de parenté. 1 Exemple : Plasmodium falciparum Genre espèce Embranchement : Apicomplexa. Famille : Plasmodiidae Ordre : Haemosporidia Classe : Sporozoaires Genre: Plasmodium Espèce : falciparum III. Classification traditionnelle Divise le monde vivant en six règnes : 1. Les bactéries procaryotes = unicellulaires 2. Les archées (procaryotes, souvent extrêmophiles) 3. Les protistes (eucaryotes le plus souvent unicellulaires) 4. Les champignons (eucaryotes multicellulaires hétérotrophes) 5. Les végétaux (eucaryotes multicellulaires, réalisant la photosynthèse) 6. Les animaux (eucaryotes multicellulaires hétérotrophes qui ingèrent des composés carbonés – animaux, végétaux). ✔ Parmi les procaryotes (archées) peuvent survivre dans des habitats extrêmes tels que les sources hydrothermales sous-marines, les océans, les zones froides et les déserts, les environnements acides et alcalins extrêmes et les conditions de pression sont collectivement appelés extrémophiles ✔ Un organisme hétérotrophe est un organisme qui se nourrit en consommant d’autres organismes ou de la matière organique. A. Les protozoaires (règne des protistes) Sont des organismes unicellulaires microscopiques dont l’unique cellule remplies toutes les fonctions nécessaires à leur vie. Ils se présentent sous des formes très variées et colonisent tous les milieux aquatiques (formes libres) et le milieu biologique (formes commensales, symbiotes et parasites). Il se multiplient par mitose (reproduction asexuée) mais certains ont une reproduction à caractère sexuel Les différentes fonctions des protozoaires sont assurées grâce à des organites variés: La fonction locomotrice par exemple par les cils, les flagelles, La fonction squelettique par les fibres et les microtubules etc. Systématique des protozoaires En fonction ▪ Des caractères du cycle de développement ▪ La nature de l’appareil locomoteur On distingue les embranchements suivants 1. Les Rhizoflagellés ✔ Rhizopodes ✔ Flagellés. 2 Photo n°1 : d’un rhizopode Mobile à l’aide de pseudopodes Photo n°2 :d’un flagellé mobile à l’aide de flagelles Les pseudopodes sont des déformations de la membrane plasmique qui permettent à une cellule de se nourrir et se déplacer Le flagelle filament mobile, unique ou multiple, long, fixé à la surface de nombreuses cellules (protozoaires flagellés ; bactéries mobiles ; spermatozoïdes des diverses espèces animales 2. Les Actinopodes Eucaryotes unicellulaires, protozoaires marins ou d'eau douce caractérisés par l’existence d'axopodes, sortes de fins pseudopodes. Photo n°3 : d’un actinopode 3. Les Cnidosporidies ✔ Parasites de l'intestin des reptiles, des amphibiens, ou des poissons 4. Les Infusoires ou Ciliés ✔ Caractérisés par la présence de cils cellulaires à leur surface à au moins un instant de leur cycle. 5. Les sporozoaires ✔ Un sporozoaire est un parasite dont la cellule est haploïde, Le nom de Sporozoa vient du mode de reproduction par sporulation, avec un ensemble d'organites dans le sporozoïte. Ils font partie des Apicomplexa Exemple de protozoaire parasite de l’Homme Plasmodium genre de protozoaire causant le paludisme (malaria) infection parasitaire mortelle. Transmit par la piqûre de l’anophèle femelle. Le parasite infecte les cellules hépatiques puis regagne la circulation sanguine en infectant les érythrocytes. B. Les métazoaires 3 Organismes eucaryotes pluricellulaires mobiles et hétérotrophes. Les divers embranchements peuvent être regroupés en tenant compte des modalités et du degré de complexité de leur développement embryonnaire. Le développement embryonnaire des Métazoaires comprend les stades suivants: La cellule-œuf (zygote) issue de la fécondation subit une succession de divisions mitotiques (segmentation) qui aboutit à la formation d’une masse cellulaire appelée morula qui va se creuse d’une cavité appelée blastocœle : le stade blastula. Le stade suivant : Gastrulation qui correspond à la mise en place des feuillets embryonnaires La blastula se transforme en gastrula, limité par deux feuillets embryonnaires: 1. Stade diploblastique 1. feuillet externe: l’Ectoderme 2.feuillet interne: l’Endoderme 2. Stade triploblastique : caractérisé par l’apparition d’un troisième feuillet: Le mésoderme 1. Diploblastiques Ce sont les plus primitifs des métazoaires et leur organisation est très rudimentaires possédant deux feuillets embryonnaires. Ce groupe comprend les embranchements suivants: Spongiaires : aquatiques surtout marins Cnidaires:(Classes: Hydrozoaires(l’hydre); Anthozoaires(corail); Acalèphes (Les grandes méduses). 2. Les Triploblastiques Métazoaires caractérisés par l’apparition, au cours de leur développement embryonnaire: 3eme feuillet: Mésoderme. Selon la destinée du Mésoderme les triploblastiques se divisent en deux groupes: Les Acœlomates : comprennent les Némathelminthes, les Plathelminthes, les Némertiens, les Rotifères et quelques autres groupes de moindre importance Les Cœlomates (les Protostomiens et les Deutérostomiens). Némathelminthes, les Plathelminthes Némathelminthes : vers ronds, triploblastiques pseudocœlomates, regroupant les Nématodes certains parasites de l’homme (ascaris, oxyure), les Nématomorphes Plathelminthes vers plats certains sont parasites de l’homme (tænia, douve, schistosome.) Némertiens: vers aquatiques Rotifères : parasites de crustacés et de mollusques Et enfin les Embranchements suivants: Tuniciers- Céphalocordés et Vertébrés : Organismes marins présentent des affinités profondes avec les Vertébrés 4