Cours virologie (1).docx

Gastroentérites: Rotavirus: 1ère cause des GEA de l’enfant < 5 ans, partout dans le monde, pic épidémique en hiver. 1ère cause d’infection nosocomiale en pédiatrie Épidémies dans les crèches +++ Transmission féco-oral. Physiopathologie: Diarrhée : Trouble au niveau de la fonction de la sécrétion...

Gastroentérites: Rotavirus: 1ère cause des GEA de l’enfant < 5 ans, partout dans le monde, pic épidémique en hiver. 1ère cause d’infection nosocomiale en pédiatrie Épidémies dans les crèches +++ Transmission féco-oral. Physiopathologie: Diarrhée : Trouble au niveau de la fonction de la sécrétion et de la réabsorption. Tropisme pour entérocytes (intestin grêle) =>lésions à l’origine d’une diarrhée multifactorielle. Traitement: Réhydratation orale ou IV si sévère. Anti-émétiques et Antipyrétiques Régime alimentaire Prévention: Non spécifique: lavage des mains et éducation. Spécifique: vaccination, vaccin vivant atténué ou virus recombinants. Caliciviridae / Norovirus: 1ère cause de diarrhée épidémique tout âge confondu. Responsable de 90% des GEA d’origine alimentaire ou hydrique majorité des GEA dans les collectivités. (huîtres, crevettes, fruits et légumes) Transmission féco-oral. Aliments contaminés par eaux souillées, rejet d’eaux usées contaminées. Adénovirus: Infections nosocomiales Astrovirus: DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE DES GEA Prélèvement de selles 1) Détection Ag viral Kit ELISA (Rota, Adéno, noro , astro) Test d’Immuno-chromatographie (test unitaire) +++ (Rota, Adéno, noro) test combiné rota+adeno 2) Détection génome viral PCR voire PCR multiplex : pas en routine exception norovirus : inf fréquente chez greffés d’où suivi PCR Annales: Quelles sont les techniques virologiques utilisées dans ce cadre ? La détection Ag viral par ELISA ou immuno-chromatographie et la détection du génome viral par PCR A partir de quels prélèvements ? Des selles Qu’est-ce qu’un biofilm bactérien ? Communautés hétérogènes de bactéries entourées d’une matrice autoproduite. Quels sont les avantages conférés par cet état aux bactéries qui le composent ? Ils ont une résistance aux vis-à vis du système immunitaire, une résistance aux antibiotiques, antiseptiques et agents désinfectants et entraînent une corrosion et altération des surfaces Syndromes diarrhéiques chez l’homme: Citez les microorganismes (bactéries, virus, parasites) pouvant être à l’origine de ces pathologies / Quels sont les virus, bactéries à l’origine de gastro-entérite que l’on peut rechercher dans ces aliments ? Virus 80 % des GEA: Rotavirus Norovirus Adenovirus 40/41 Astrovirus : Bactéries: Salmonella, shigella, campylobacter, Yersinia, E-coli, vibrio cholerae Parasites: Giardia Cryptosporidies amibes Quelle est la principale complication de la diarrhée ? La déshydratation Quels en sont les signes cliniques ? Multiplication virale dans les entérocytes => malabsorption et donc diarrhée avec déshydratation. Au moins 3 selles liquides ou molles par jour depuis moins de 14 jours Troubles digestifs aigus: diarrhées hydriques, vomissements, nausées, douleurs abdominales Perte de poids Transmission: Fécale-orale de personne à personne par manque d’hygiène, mains sales (vomissures) Environnement souillé (eaux ou aliments) Hepatites E et A: Famille des picornaviridae, petit virus a ARN. Lésions inflammatoires du foie + altération des hépatocytes Clinique : ictère Si passage à la chronicité: Gravité= fibrose → cirrhose → cancer du foie Hépatite A: Réservoir virus = sujet infecté Source de contamination Transmission directe : fécale-orale, Mains sales, aliments contaminés SELLES CONTAGIEUSES avant l’apparition de l’ictère, pdt, et 1 à 2 semaines après Risque d’infection est lié au manque d’eau potable et à l’insuffisance de l’assainissement et de l’hygiène Pays où circule le virus Automne :pays tempérés, saison des pluies :pays chauds La distribution HAV dans le monde est corrélée au statut socio-économique Pays en voie développement. Fruits rouges congelés, tomates sechés Signes cliniques Pseudo-grippal (fièvre, myalgies, asthénie), Troubles digestifs (vomissements), Ictères, Selles décolorées, Urines foncées Moyens de prévention Hygiène générale et collective (personnel de cuisine, collectivités) éviction 10j Surveillance eaux de récoltes des coquillages Traitements eaux des piscines Vaccin pour prévenir l'hépatite, il s’agit d’un vaccin inactivé. Technique pour mettre en évidence le virus, développer le principe de la technique Il y a le diagnostique biologique ou on recherche des IgM spécifiques (ELISA), les IgM HAV. On regarde aussi le statut immunitaire en recherchant un IgM spécifique (ELISA), IgM HAV. Hépatite E Hepeviridae Virus ARN, nu. Distribution mondiale de l’HEV Endémique en Asie de l’Est et du Sud, Afrique, Amérique Centrale. Transmission: Voie hydrique (génotype 1 et 2) Transmission zoonotique (Porc) Le virus de l’hépatite E se transmet principalement par la voie fécale orale du fait de la contamination fécale de l’eau de boisson. Les aliments due à l’ingestion de produits dérivés d’animaux infectés. Coquillages. La transfusion de produits sanguins infectés. La transmission verticale d’une femme enceinte au foetus. Diagnostique: Recherche IgG et IgM HEV (ELISA) (en routine). PCR plasma et selles TRAITEMENT ET PRÉVENTION Pas de traitement Ribavirine chez ID (HEV chronique) Règles élémentaires d’hygiène Quel est le virus le plus probablement en cause ? (framboises congelées) Quel est l’examen de laboratoire qui permet d’identifier le virus en cause dans les framboises ? Quels sont les signes cliniques d’une hépatite aigue chez un patient infecté ? De quelle manière ces framboises ont-elles été contaminées ? Hépatite E : structure, mode de transmission, pouvoir pathogène, diagnostic, et prévention. Hepatite A Source de contamination Technique pour mettre en évidence le virus, développer le principe de la technique Signes cliniques Pays où circule le virus Moyens de prévention Modes de transimission? Entérovirus RHINOVIRUS , rhume Réservoir des entérovirus est humain Grande quantité de virus dans les selles (105 virus/g selle) Virus très résistants dans environnement. Transmission fécale orale indirecte : eaux, aliments ou coquillages contaminés Les infections à entérovirus existent dans le monde entier- Forme endémique : zone tropicale Forme épidémique : pays tempérés La période de circulation est l’été et l’automne POUVOIR PATHOGÈNE DES ENTEROVIRUS Les entérovirus peuvent induire différentes pathologies selon leur tropisme tissulaire4 : Tropisme digestif : gastro-entérites, Tropisme respiratoire : bronchiolites, pneumonies Tropisme neurologique : méningites, encéphalites, paralysies Tropisme cutané : éruptions vésiculeuses Infections aiguës: Bénignes Fièvre, inf ORL, conjonctivite Infection pieds mains bouche (CoxA16, EV-A71) avec hospitalisation Fréquente : Méningite aiguë Péricardite, myocardite + rares : paralysie flasque et encéphalite Diagnostique des entérovirus: Isolement en culture cellulaire (direct) et RT-PCR (indirect) Isolement par culture cellulaire Les prélèvements les plus adaptés sont effectués précocement : gorge, selles, liquide céphalorachidien (LCR)4 L'identification se fait par :L'observation d'un effet cytopathique (ECP) caractéristique avec des inclusions cytoplasmiques et un noyau repoussé en "béret basque" Diagnostic par RT-PCR La RT-PCR est actuellement la technique de choix pour le diagnostic des infections à entérovirus Elle est surtout indiquée en cas de suspicion de méningite à entérovirus chez les jeunes enfants. TRAITEMENT- PREVENTION Non spécifique, hygiène Spécifique: vaccin anti-polio, inactivé injectable atténué, oral La polio: Couverture vaccinale Destruction des neurones moteurs de la corne antérieure de la moelle épinière, une infection sur 200 /paralysie irréversible 15 Jours incubation, débute fièvre inf rhinopharyngée douleurs musculaires paralysies flasques. Atteinte muscles respiratoires = 5 à 10% cas Décès Amyotrophie d’un membre, boiterie Infections chroniques- Pathologie musculaire Cardiaque Diabète Quelles sont les modes de transmission de ces virus ? Définissez la période de circulation des entérovirus. Quels sont les signes cliniques d’une infection à entérovirus Quelles sont les techniques utilisées pour mettre en évidence ces virus ?