מבנה נוגדן - PDF

## מבנה סבמתי של אתר הקישור לאנטיגן - כאשר מבצעים קריסטלוגרפיה ודפרקציה בקרני X על נוגדן מגובש (בהתחלה נעשה על המיאלומה) ניתן לראות בי אתר הקישור לאנטיגן בנוי מקומבינציה של שישה אזורים וריאביליים, אשר נמצאים בנפרד על פני השרשראות. - נוצר אתר קישור תלת-מימדי על ידי דחיפה של האזורים הוריאביליים...

## מבנה סבמתי של אתר הקישור לאנטיגן - כאשר מבצעים קריסטלוגרפיה ודפרקציה בקרני X על נוגדן מגובש (בהתחלה נעשה על המיאלומה) ניתן לראות בי אתר הקישור לאנטיגן בנוי מקומבינציה של שישה אזורים וריאביליים, אשר נמצאים בנפרד על פני השרשראות. - נוצר אתר קישור תלת-מימדי על ידי דחיפה של האזורים הוריאביליים לפרוקסימציה פיזית במרחב. - באופן זה נוצר אתר קישור אשר מכוון לאפיטופ, דטרמיננטה אפיגנתית אחת. - כל שינוי ברצף של אחד משלושת האזורים הוריאביליים ייתן אתר קישור אחר. - דבר זה מזכיר התאמה בין מפתח למנעול, אשר מבוסס על התאמה אופטימלית בין מבנים תלת-מימדיים. - הם **internal images** אחד של השני. - הספציפיות של מולקולת הנוגדן מבוססת על ההיפרוריאביליות. ## מבנה גלובולרי של שרשרת קלה - ניתן לקבל תובנות נוספות ממבנה הנוגדן. - כאשר מבצעים דיפרקציה מקרני X על שרשראות קלות ניתן לראות שני חלבונים גלובולריים, אשר מתאפשרים אודות לשיירים ציסטאינים אשר נמצאים ברצף הראשוני בעמדות קבועות. - דבר זה מאפשר יצירת לולאה של כ-60 חומצות אמינו, מה שיוצר מבנה גלובולרי - אזור אשר כולל את שלושת האזורים ההיפרוריאביליים. - לולאה נוספת יוצרת את האזור הקבוע של השרשרת. - בשרשרת הכבדה המבנה מבוסס על ארבעת לופים בתוך השרשרת, בשל הימצאותם של ציסטאינים. - שלושה מבנים גלובולריים בונים את האזור הקבוע. - זהו מבנה מאוד שמור לאורך האבולוציה של מערכת החיסון. - הרצף הכללי של השרשראות שונה בין אורגניזמים, אך מיקום הקשרים הציסטאינים תמיד קבוע. - כאשר ישנה מוטציה אשר משנה את הציסטאין לחומצה אמינית אחרת, לא ייוצר המבנה הגלובולארי, אשר חשוב ביותר ליצירת אתר הקישור. ## Immunoglobin Structure - הקישור של הנוגדן לפתוגן מאותת למרכיבים נוספים של מערכת החיסון כי ישנו פתוגן אשר יש להילחם בו. - הנוגדן אשר קשור לאנטיגן, אשר עובר שינוי אלוסטרי קטן, מגייס מנגנוני ניטרול והרס. - הגיוס מתבצע על סמך המבנים השמורים של האזורים הקבועים. **רצפטורים ל-FC נמצאים על גבי תאים בולעניים.** **חלבוני משלים ממיסים את החיידק (ליזיס).** **ישנו אזור אשר חשוב למעבר הנוגדן בשיליה, בשל להקנות לעובר מערכת חיסונית בשלבים המוקדמים של חייהם.** - מעבר למנגנונים אשר דיברנו עליהם, ישנו אזור של כ-15 חומצות אמינו בשרשרת הכבדה, בין CH2-CH1. - רצף זה הינו עשיר בפרולין, חומצה אמינית אשר מקנה אפשרות לכיפוף. - אזור זה נקרא אזור ה-hinge. - בכדי שמערכת החיסון תופעל כתוצאה מהקישור של נוגדן-אנטיגן, על הנוגדן להיקשר בשני הזרועות לדטרמיננטה האנטיגנית. - בבדי ששתי הזרועות יתקשרו באותו הזמן, אזור ה-hinge מאפשר התרחקות והתקרבות בין הזרועות. - מולקולת הנוגדן אינה ערומה, אלה קשורה לקבוצות סוכר (גליקופרוטאין). - לאחר שהשרשראות נוצרות בתא, מתחברים אליהם הסוכרים במערכת הגולג'י (צירוף carbohydrates). - בחיידקים אין גולג'י, ולכן אין להם סוכרים. - לנוגדן מסוג זה אין יכולת גיוס של מנגנוני גיוס והרס (אין להם יכולת נוספת פרט מקישור). ## מנגנוני הגנה באמצעות נוגדנים - **ניטרול** - אם נוגדן נקשר באתר הפעיל של חלבון פתוגני (רעלן), הוא יכול לנטרל אותו. עצם הקישור יוצר חסימה. - **קישור צולב (השקעה/אגלוטינציה)** - ערבוב של נוגדן עם חומר אשר אינו מסיס, בגון חיידק או בדורית דם אדומה, יוצר אגלוטינציה (צימות). זה אינו משקע, אך הבסיס של התופעה הינו דומה. הנוגדן יוצר קישור צולב עם הפתוגן ומניב אגרגטים גדולים של החיידק, מה שעוזר בזיהוי של החיידק על ידי מנגנוני ההרס בתא. - **אופסוניזציה** - תיבול. תופעה זו מזכירה מצב שבו הנוגדן משמש בתבלין, אשר הופך את החיידק ליותר "טעים" עבור התאים הבולעניים. כאשר נוגדן נקשר לחיידק בחלל החוץ תאי ומצפה אותו הם מאפשרים לתאים בלעניים לזהות את החיידק באופן ספציפי באמצעות קולטני FC אשר מזהים את המבנה התלת-מימדי של המבנה הקבוע של הנוגדן. באמצעות הקולטנים התאים נצמדים אל החיידק ובולעים אותו בתהליך של פאגוציטוזה. הנוגדנים מעלים את עוצמת הבליעה בעשרות מונים. - **הפעלת משלים (complement)** - מערכת של חלבונים אשר נמצאים בדם. כאשר הם מזהים קישור של נוגדן לחיידק הם מופעלים על ידי האזורים הקבועים של מולקולת הנוגדן, ונקשרים אחד לשני במערכת מתוזמנת בבדי לגרום לליזיס של החיידק. - הגברה של פעולת האופסוניזציה ע"י קולטני משלים (הכרה כפולה) - חירור ממברנת החיידק על ידי החלבונים (ליזיס ישיר של החיידק) ישנה פעילות כפולה: הנוגדנים מזהים את החיידק וקוראים לתאים מאקרופאגים, ובמקביל קוראים לחלבונים ממערכת המשלים היוצרים חורים על הממברנה וגורמים למות החיידק.