2e partie - III. Phénomènes biologiques - ch 1 Organismes vivant dans le sol PDF

2e partie : Propriétés 1 globales du sol III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Ch 2 : Principales interventions microbiennes 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 2 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organism...

2e partie : Propriétés 1 globales du sol III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Ch 2 : Principales interventions microbiennes 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 2 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Sol = milieu vivant complexe, très hétérogène Vie la plus active dans les couches superficielles Les organisme y vivent le plus souvent Chaines trophiques nombreuses et variées 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 3 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol 1. Faune du sol Classification selon la taille - Mégafaune : > 80 mm : reptiles, rongeurs,… - Macrofaune (identifiable à l’œil nu): 4 – 80 mm : insectes, lombrics, mollusques, arachnides, … - Mésofaune (visible à la loupe) : 0,2 - 4 mm : collemboles, acariens,… - Microfaune (identifiable en microscopie) : < 0,2 mm : nématodes, protozoaires 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 4 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 5 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 6 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Terrier blaireau (mégafaune) 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 7 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol iule lithobie cloporte pseudoscorpion 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 8 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Lombric 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 9 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Collemboles et acariens Mésophaune 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 10 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol nématode protozoaires 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 11 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Faune = partie intégrante du sol Participe à - Son fonctionnement - Son évolution 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 12 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Régimes alimentaires diversifiés - Saprophages, détritiphages, coprophages,… SE NOURRISSENT DE CADAVRE - Phytophages SE NOURRISSENT DE PLANTE VIVANTE - Prédateurs SE NOURRISENT DE VEGETAUX VIVANT - Parasites - …. 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 13 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 14 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Lombricidés (= vers de terre) En moy : 1 tonne/ha → 2,5 à 3 T dans les conditions les plus favorables, = ingénieurs de l’écosystème Peuvent ingérer jusqu’à 40 T de terre/ha/an Influence sur phénomènes physiques , chimiques et biologiques 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol  Ingestion par les verre de terre “ 15 ” 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 16 Vers de fumier (Eisenia fetida) Lombricompost 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 17 Lumbricus terrestris 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 18 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol galeries turricules 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 19 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Travail du ver de terre 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 20 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Fonctions exercées par la faune - Physiques : fragmentation de la MO macrobrassage microbrassage galeries agrégats 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 21 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol - Chimiques : libération él min - Biologiques : minéralisation mat org permet un renouvellement de la pop des microorga prédation microorg dissémination microorg décomposition cadavres https://www.youtube.com/watch?v=mwTaKQUCV aQ (vers de terre, indicateurs de fonctionnement du sol) https://www.youtube.com/watch?v=pcrrA-Am6oQ (vie et mort des sols) 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 22 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol 2. Microorganismes Aussi microflore, biomasse microbienne - Rôles essentiels dans les cycles biogéochimiques (C, N, …) - Action sur la croissance et la santé des plantes - Influence sur la qualité de notre environnement(sol, atmosphère, eau, …) 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 23 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol 2. Microorganismes 2.1. Population microbienne des sols Microorganismes présents et caractéristiques de 10 à centaines de milliers taxons/g sol, 109 ind/g sol milliard d'individu Variant rapidement avec le temps Plus de 5 tonnes/ha Algues, champignons, actinomycètes (= eubactéries gram +) et bactéries 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 24 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Champignons ( 104 à 106/g de terre): - hétérotrophes, aérobies se développent présence d'oxygène - Actions : décomposition de la litière (cellulose, lignine, …), humification - Cond développement : bonne résistance à la sécheresse, cond acides - Surtout décomposition MOF 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 25 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Bactéries (108 à 109/g de terre) - Hétérotrophes surtout et certaines autotrophes, aérobies et anaérobies - Actions : toutes activités, très diversifiées - Cond développement : actions idéales si O2, pH proche neutralité, t° et humidité - Aérobie amènent les transformation les plus intéressante 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 26 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Actinomycètes = eubactéries gram+ - hétérotrophes, saprophytes - Décomposition lignine, tannins - Humification 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 27 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 28 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 29 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 30 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Diversité et faculté d’adaptation Grande diversité des espèces → Adaptation à des conditions très variées → Participation à beaucoup de réactions (synthèse, dégradation) Classification En groupes, biocénoses Par ex : bactéries du cycle de l’azote, bact cellulolytiques, bact rhizosphériques, … 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 31 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol 2.2. Croissance et dissémination des microorganismes 1er phase: La MOF est propice aux développement des microorganisme 2eme phase: croissance beaucoup plus rapide à disposition une quantité de nourriture et de substrat. Elle est active. 4ème phase: phase de décroissance, la MO est décomposer la pop commence à décroitre Évolution par rapport à un apport en matières organiques fraiches 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 32 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol En dehors des apports, population relativement stable Dissémination par l’eau et dans l’eau par le brassage de la faune par le travail du sol Entraine les microorganisme dans les MO les plus présente dans le sol 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 33 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol 2.3. Croissance et environnement Facteurs énergétiques Substrats organiques → énergie et carbone (hétérotrophes) = la majorité Autotrophes : rares Chimiolithotrophes : énergie venant de l’oxydation de substances minérales (ammoniac, composés soufrés réduits), carbonates ou CO2 comme source de C 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 34 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Facteurs chimiques Eléments minéraux dissous ou venant de la minéralisation de la matière organique. Parfois concurrence avec la plante cultivée pour certains éléments (azote en général) pH : effet sur la disponibilité des éléments minéraux effet sur les conditions du milieu 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 35 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Conditions pédoclimatiques - Température : action sur la composition et l’activité de la microflore - Eau : composant, effet sur les échanges gazeux et le transport des éléments solubles. - O2 : aérobies obligatoires, aérobies, facultatifs, anaérobies - pH : champignons acidophiles, bactéries surtout neutrophiles 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 36 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol 2.4. Interventions sur la population microbienne Objectifs : accroitre les actions favorables, ralentir les activités nuisibles, stimuler les activités bénéfiques d’intensité faible. Actions directes Bactérisation, mycorhizationentre en symbiose avec la plante (relation d'amicalité) Stérilisation du sol Eliminer tous les microorganisme (qui sont bénéfique ou nuisible) Utilisation de microorganismes auxiliaires : stimulateurs de croissance, biodécomposeurs,… 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 37 III. Phénomènes biologiques Ch 1 : Organismes vivant dans le sol Actions indirectes Améliorer les propriétés physiques et chimiques du sol Rotation des cultures Travail du sol Apports d’amendements organiques, engrais verts,… (= nourrir les microorganismes) Action mal connue des produits phytopharmaceutiques Molécules organique (microorganisme peuvent s'y attaquer) perd donc sont efficacité 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol 38 http://www.lemonde.fr/sciences/video/2014/08/31/la- science-au-chevet-des-sols- agricoles_4479455_1650684.html https://www.youtube.com/watch?v=LPM94Z1OttU (les habitants du sol et leur importance) 2e partie - III. Phénomènes biologiques ch 1 Organismes vivant dans le sol