20221206-水島(代謝まとめ・がん代謝) PDF
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These notes cover various aspects of metabolism, particularly focused on cancer metabolism. It includes diagrams and descriptions for understanding metabolic pathways, the history of cancer research, the Warburg effect, cell culture, and more. There are also exam questions included.
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糖代謝(1) • • • • • 解糖系 糖新生 クエン酸回路 電子伝達系 最近のトピックス がん代謝 がん研究の歴史 がんは代謝病? ↓ 分子生物学勃興 がん遺伝子/抑制遺伝子の相次ぐ発見 ↓ 実はそれらの多くは代謝を制御していた 例:p53、Mycなど グルコース グリコーゲン トリアシルグリセロール グルコース 6-リン酸...
糖代謝(1) • • • • • 解糖系 糖新生 クエン酸回路 電子伝達系 最近のトピックス がん代謝 がん研究の歴史 がんは代謝病? ↓ 分子生物学勃興 がん遺伝子/抑制遺伝子の相次ぐ発見 ↓ 実はそれらの多くは代謝を制御していた 例:p53、Mycなど グルコース グリコーゲン トリアシルグリセロール グルコース 6-リン酸 核酸塩基 ジヒドロキシアセトンリン酸 グリセロール 脂肪酸 ホスホエノールピルビン酸 オキサロ酢酸 アセチルCoA ピルビン酸 乳酸 β-ヒドロキシ酪酸 オキサロ酢酸 リンゴ酸 アセト酢酸 クエン酸 ATP H2O O2 ミトコンドリア α-ケトグルタル酸 NH4+ CO2 尿素 Warburg効果 酸素があるにもかかわらず、がん細胞は解糖系に依存し、乳酸を蓄積 させる。=好気的解糖 by Otto Warburg (1924?) グルコースの代謝産物はATPだけではない! 生合成維持 ペントースリン酸回路への基質供給(核酸合成) 脂質合成 乳酸を産生 酸化力維持 組織環境が酸性化し腫瘍の侵入が促進 免疫系抑制 酸素温存 解糖系によるATP産生は酸化的リン酸化より速い (数十倍~100倍) 2015年定期試験問題 細胞数(OD660) ①正常細胞 グルコース培地 ②呼吸欠損細胞 グルコース培地 ③正常細胞 グリセロール培地 ④呼吸欠損細胞 グリセロール培地 時間(h) ヒト細胞での代謝マップ(図3)を参考にして、以下の2つの問に答えなさい。 (問1) 第1相と第2相ではどのようにしてATPを産生していると考えられるか? (問2) ②と③の細胞は増殖できるのに④の細胞は全く増殖できない。なぜ呼吸欠損 細胞はグルコースを栄養とすることができるのに、グリセロールを栄養とすることがで きないか? 還元的クエン 酸回路 Glutaminolysis Finley et al. Cell Metab. 17:466 (2013) Wang et al., 2022, Molecular Cell 82, 3270–3283 グルコース NAD+ ATP NADH 乳酸 ピルビン酸 ピルビン酸輸送体 O2 H H 2O シャトル CO2 ATP ATPーADP トランスロカーゼ がん細胞の代謝変化 核酸 脂質 PKM2 IDH mutation Benjamin et al. Cell Metab 2012, 16:565 NADH+H+ IDH FADH2 NADH+H+ CO2 (対称性) GTP(肝臓) ATP(筋・心) (2-オキソグルタル酸) CO2 NADH+H+ Losman and Kaelin Jr. Genes Dev. 27:836 (2013) 質問 Losman and Kaelin Jr. Genes Dev. 27:836 (2013) オンコメタボライト(oncometabolite) α-ケトグルタル酸依存的ジオキシゲナーゼを拮抗阻害 プロリン水酸化酵素(→HIF1の分解阻害) メチルシトシン酸化酵素TET2(→エピジェネティクス異常) ヒストン脱メチル化酵素KDM4C (→エピジェティクス異常) Losman and Kaelin Jr. Genes Dev. 27:836 (2013) Sullivan et al. Cell 162:552 (2015) アスパラギン酸合成のための電 子の受取手として呼吸(酸化的 リン酸化)が必要 (必ずしもATPを作ることだけが 呼吸の役割では無い) Birsoy et al. Cell 162:540 (2015) 理解すべきこと • がん細胞がもつ代謝学的特徴 • がん細胞にとってのグルコースの使い道 • オンコメタボライト(oncometabolite)とは 今は特に記憶しなくてよいこと