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Questions and Answers
¿Cuál es la primera fase del proceso de traducción?
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¿Qué función realiza la subunidad grande de los ribosomas?
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¿Qué se necesita para la síntesis de un polipéptido durante la traducción?
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¿Dónde se produce la unión de la cadena peptídica durante la traducción?
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¿Qué estructura tienen los tARN?
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¿Cuál de los siguientes no es un requisito para el proceso de traducción?
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¿Qué función tiene el sitio de translocación en el ribosoma?
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¿Cuál es el resultado final del proceso de traducción?
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¿Cuál es la primera acción que realiza el factor de transcripción TBP durante la iniciación de la transcripción?
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¿Qué factores de transcripción se unen a la ARN polimerasa para formar el complejo de iniciación?
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¿Cuál es la función del TF2H en el complejo de iniciación?
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¿Qué proceso permite el movimiento de la ARN polimerasa durante la elongación?
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¿Qué ocurre en la fase de terminación de la transcripción?
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¿Cuál de las siguientes afirmaciones describe mejor la hipótesis secuencial en la formación del complejo de iniciación?
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¿Qué tipo de nucleótidos se sintetizan en la fase de iniciación?
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¿Qué papel juega el TF2E en el proceso de iniciación?
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¿Cuál es la función de la RNA fosfatasa en el proceso de unión del GTP al mRNA?
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¿Qué tipo de caperuza está presente en el mRNA y determina su funcionalidad en organismos no eucariotas?
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¿Cuál es el papel principal de la cola poli-A en el mRNA?
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¿Qué sucede durante la escisión del pre-ARN con respecto a la secuencia consenso?
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¿Cuál es la única polimerasa que no necesita molde durante la poliadenilación?
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En el proceso de splicing, ¿qué se elimina del mRNA?
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¿Qué secuencias son reconocidas por el espliceosoma durante el splicing?
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¿Qué tipo de metilación se realiza en la caperuza 2 del mRNA?
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¿Qué componentes forman el complejo ternario de preiniciación?
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¿Qué papel juega eIF-5 en el proceso de iniciación de la traducción?
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¿Cuál es la función de la secuencia de Kozak en la traducción?
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¿Qué sucede en el sitio A durante la elongación?
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¿Qué significa la hidrolisis del GTP durante la iniciación?
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¿Cuándo se libera la subunidad grande del ribosoma?
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¿Qué implica el movimiento de la subunidad pequeña sobre el mARN?
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¿Qué garantiza una unión correcta en la elongación entre el tARN y el codón del mARN?
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¿Qué caracteriza la relación entre un aminoácido y su sintasa en la hipótesis de balanceo?
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¿Cómo se distingue la lectura del ARNm en el proceso de traducción?
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¿Cuál es la función principal de los enlaces en la interacción codón-anticodón?
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¿Qué se entiende por la posibilidad de que un anticodón reconozca varios codones?
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¿Qué tipo de enlaces se forman entre los primeros dos nucleótidos del tARN y el codón?
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La hipótesis de balanceo ayuda a explicar cómo con 31 tRNAs es posible leer 61 codones. ¿Qué aspecto específico contribuye a esta capacidad?
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¿Qué es lo que se necesita para cubrir todas las uniones a los codones en la traducción de proteínas?
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¿Cuál de estas afirmaciones describe mejor la lectura de codones en eucariotas?
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Study Notes
Etapas de la transcripción
-
Iniciación: Formación de la burbuja de transcripción por el complejo de iniciación.
- Reconocimiento del promotor por factores de transcripción (FT).
- Unión de la ARN polimerasa.
- Apertura de la cadena de ADN.
- Unión de los dos primeros nucleótidos y síntesis de hasta 12 nucleótidos, generando un híbrido de ADN y ARN.
-
Elongación: Fosforilación del CTD (dominio carboxilo terminal) y liberación del promotor.
- Esto permite el movimiento de la ARN polimerasa para copiar la cadena de ADN.
-
Terminación: Señalización por secuencias de terminación.
- Liberación del ARN heterogéneo nuclear (ARNhn) y la ARN polimerasa.
Proceso global de la transcripción: Iniciación
- La fase de iniciación comienza con el reconocimiento del promotor por la ARN polimerasa, en su forma no fosforilada del dominio CTD.
- El factor de transcripción TBP (proteína de unión a TATA) reconoce la secuencia TATA del promotor, comenzando la apertura de la cadena de ADN sin incluir la secuencia TATA en la burbuja de transcripción.
- Simultaneamente, se unen los factores de transcripción TF2B y TF2D, permitiendo la unión de la ARN polimerasa desfosforilada a la región.
- La unión de TF2F y TF2H, con actividad helicasa, desenrolla y abre la hebra de ADN.
- TF2E (molécula de unión a cadena simple) mantiene la hebra abierta.
- Existen dos hipótesis sobre cómo se forma el complejo de iniciación:
- Hipótesis secuencial: Los FTs se unen de forma secuencial, uno tras otro, activando la siguiente reacción.
- Hipótesis holoenzima: La ARN polimerasa se une a todos los FTs, formando la holoenzima, que se une al ADN para iniciar la transcripción.
- Tras la unión de la ARN polimerasa y los FTs, se forma el primer enlace fosfodiéster, emparejando el ADN molde con 12 nucleótidos de ARN recién sintetizado.
Modificaciones post-transcripcionales: Caperuza 5'
- Para unir el GTP al extremo 5' del ARN, se requieren enzimas:
- Una RNA fosfatasa elimina un grupo fosfato en posición gamma del mRNA.
- La guanidil transferasa une GTP al extremo 5' del mRNA, es una unión atípica.
- Existen diferentes tipos de caperuza 5':
- Caperuza 0: Metilación de guanina.
- Caperuza 1: Metilación de guanina + OH del primer nucleótido del transcrito.
- Caperuza 2: Metilación de guanina + OH del primer y segundo nucleótido.
- La caperuza 5' tiene varias funciones:
- Proteger el ARN de la degradación.
- Ayudar en el reconocimiento del ARN por el ribosoma.
- Mejorar la eficiencia de la traducción.
- La caperuza 2 está relacionada con el sistema inmune, diferenciando los ARN propios de los extraños.
Modificaciones post-transcripcionales: Cola poli(A)
- Es la adición de una cola de adenosinas al extremo 3' del mRNA.
- La cola poli(A) proporciona estabilidad a la molécula, protege el ARN de la degradación y determina su vida media.
- La cola poli(A) también facilita el transporte del mRNA maduro al citoplasma.
- El proceso de poliadenilación se divide en dos pasos:
- Escisión del pre-ARN: Una endonucleasa corta la cadena de ARN unos 30 nucleótidos después de la secuencia consenso (AAUAAA), que indica el punto de colocación de la cola poli(A).
- Poliadenilación del extremo 3': La poli-A-polimerasa (la única polimerasa que no necesita molde) añade adenosinas al extremo 3' del mRNA, consumiendo ATP.
- Se unen proteínas de estabilización a la cola poli(A).
Splicing - Eliminación de intrones y empalme de exones
- Es el proceso de eliminación de intrones y unión de exones para formar el mRNA maduro.
- Los intrones contienen secuencias específicas que participan en el splicing:
- Centro de ramificación, con una adenina.
- Centro de ayuste 5', con guanina y uracilo.
- Centro de ayuste 3', con adenina y guanina.
- El espliceosoma (complejo de proteínas y ARN) reconoce estas secuencias consenso.
- El splicing se lleva a cabo en cuatro fases: activación, iniciación, elongación y terminación.
Proceso global de la traducción
- La traducción es el proceso de síntesis de proteínas a partir de la información contenida en el mRNA.
- Se inicia en un codón de inicio (AUG) y continúa secuencialmente, leyendo tres nucleótidos (codón) a la vez.
- La traducción es específica, cada codón codifica para un único aminoácido.
Requerimientos para la traducción
- mARN para cada polipéptido.
- Ribosomas (rARN + proteínas).
- Aminoácidos para la cadena polipeptídica.
- tARN (maduros y portadores de aminoácidos).
- Sistema de traducción (código genético).
- Energía y enzimas.
- Factores de traducción para cada fase.
Maquinaria de traducción: Ribosomas 80S
- Los ribosomas son los orgánulos celulares encargados de la traducción.
- En eucariotas, los ribosomas son 80S, formados por dos subunidades:
-
Subunidad grande (60S): Con actividad peptidiltransferasa, permite la unión de aminoácidos. Contiene 49 proteínas.
- Presenta diferentes partes:
- Cresta.
- Protuberancia central.
- Tallo.
- Valle (centro activo).
- Sitio de translocación.
- Sitio de salida de la cadena polipeptídica.
- Presenta diferentes partes:
- Subunidad pequeña (40S): Presenta una hendidura que participa en la alineación del mRNA. Contiene 33 proteínas.
-
Subunidad grande (60S): Con actividad peptidiltransferasa, permite la unión de aminoácidos. Contiene 49 proteínas.
-
Funciones de los ribosomas:
- Orientar los sustratos para la formación del enlace peptídico.
- Alinear el mRNA en la iniciación.
- Controlar la fidelidad de la traducción.
- Intervenir en la terminación.
Espacios del ribosoma
- A (Aminoacilo): Entrada de los aminoacil-tARN.
- P (Peptidilo): Lugar donde se realiza la unión de la cadena a través del tARN.
- E (Exit): Salida del tARN después de liberar el aminoácido.
tARN - aminoácidos
- Los tARN presentan una estructura secundaria en forma de trébol.
- Algunos tARN pueden reconocer varios mensajeros y varios tARN pueden interaccionar con el mismo codón.
- La tercera base del anticodón del tARN no siempre se une por enlaces de Watson y Crick, lo que permite que un único tARN reconozca varios codones.
- Esto reduce el número de tARN necesarios para la traducción, lo que supone un ahorro energético.
Características de la traducción
- No es ambigua: No se puede saltar un nucleótido.
- Lectura secuencial: Los codones se leen uno tras otro.
- Lectura no solapada: Hay solo una pauta de lectura en eucariotas que siempre comienza por AUG.
Hipótesis de balanceo
- Esta hipótesis explica cómo un único tARN puede reconocer varios codones.
- La primera y segunda bases del codón y anticodón se unen por enlaces de Watson y Crick, mientras que la tercera base puede unirse por enlaces de Watson Crick o por enlaces de Hoogsteen.
- Las modificaciones post-transcripcionales en la tercera base del anticodón aumentan el número de codones que puede reconocer.
- La inosina, una modificación de la adenina, aumenta el número de posibilidades de unión.
Iniciación de la traducción
-
La iniciación comienza con la formación del complejo ternario de preiniciación: subunidad pequeña del ribosoma (40S) + mARN + metionil-tARN (Met-tRNAimet).
-
El mARN se une al factor 4 de iniciación (eIF4) y el Met-tRNAimet se une al factor 2 de iniciación (eIF2) y GTP.
-
Ambos se unen a la subunidad pequeña del ribosoma, formando el complejo de preiniciación.
-
Pasos de la iniciación:*
-
Asociación de la subunidad pequeña 40S con Met-tRNAimet.
-
Reconocimiento del CAP 5' del mARN.
-
Rastreo del ribosoma por el mARN hasta encontrar el codón de inicio AUG.
-
Unión del complejo con el AUG de iniciación, localizado en la secuencia de Kozak.
Elongación de la traducción
- La elongación es el proceso de adición de aminoácidos a la cadena polipeptídica.
- Los factores de elongación eucarióticos (eEF) participan en este proceso.
- Cada ciclo de elongación se repite en varias etapas:
- Un nuevo aminoacil-tARN se une al sitio A del ribosoma, guiado por eEF1A.
- La unión es correcta por complementariedad de bases entre el codón y el anticodón.
- La unión se fortalece por la hidrólisis del GTP asociado a eEF1A.
- La actividad peptidiltransferasa de la subunidad grande del ribosoma forma el enlace peptídico entre el aminoácido en el sitio A y el último aminoácido de la cadena en el sitio P.
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