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Questions and Answers
Quel rôle joue le promoteur en l'absence d'un opérateur chez les prokaryotes?
Quel rôle joue le promoteur en l'absence d'un opérateur chez les prokaryotes?
- Il régule la transcription des gènes voisins.
- Il fonctionne comme un activateur.
- Il relie l'ARN polymérase au gène. (correct)
- Il bloque l'expression des gènes.
Quels sont les types d'ARN polymérases présents chez les eucaryotes?
Quels sont les types d'ARN polymérases présents chez les eucaryotes?
- I, II, IV
- I, III, V
- II, III, IV
- I, II, III (correct)
Quelle affirmation à propos des opérons chez les bactéries est correcte?
Quelle affirmation à propos des opérons chez les bactéries est correcte?
- Les opérons sont souvent accompagnés de plusieurs gènes. (correct)
- Les opérons ne sont pas régulés par des promoteurs.
- Un opéron peut contenir un seul gène.
- Tous les opérons sont monocistroniques.
Quel est le rôle principal des activateurs et des inhibiteurs dans l'expression génique?
Quel est le rôle principal des activateurs et des inhibiteurs dans l'expression génique?
Quel élément n'est pas associé à l'ARN polymérase chez les prokaryotes?
Quel élément n'est pas associé à l'ARN polymérase chez les prokaryotes?
Quelle est la différence principale entre les ARN polymérases prokaryotes et eucaryotes?
Quelle est la différence principale entre les ARN polymérases prokaryotes et eucaryotes?
Quel terme décrit un gène qui partage un promoteur avec d'autres gènes?
Quel terme décrit un gène qui partage un promoteur avec d'autres gènes?
La lecture de l'ADN par l'ARN polymérase se fait sur quel brin?
La lecture de l'ADN par l'ARN polymérase se fait sur quel brin?
Quel est l'enzymes impliqué dans la digestion du lactose dans l'opéron lactose?
Quel est l'enzymes impliqué dans la digestion du lactose dans l'opéron lactose?
Quel processus détermine si un gène s'exprime ou non?
Quel processus détermine si un gène s'exprime ou non?
Quelle est la structure de base du promoteur d'un gène chez les prokaryotes ?
Quelle est la structure de base du promoteur d'un gène chez les prokaryotes ?
Quelle protéine est liée à la boîte TATA chez les eucaryotes ?
Quelle protéine est liée à la boîte TATA chez les eucaryotes ?
La boîte TATA chez les prokaryotes est reconnue par quelle protéine spécifique ?
La boîte TATA chez les prokaryotes est reconnue par quelle protéine spécifique ?
Qu'est-ce qui caractérise un gène domestique ?
Qu'est-ce qui caractérise un gène domestique ?
La région -35 du promoteur chez les bactéries est importante pour quoi ?
La région -35 du promoteur chez les bactéries est importante pour quoi ?
Quels gènes sont qualifiés de gènes inductibles ?
Quels gènes sont qualifiés de gènes inductibles ?
Quel élément joue un rôle crucial dans la fixation de l'ARN polymérase au promoteur ?
Quel élément joue un rôle crucial dans la fixation de l'ARN polymérase au promoteur ?
Quelle caractéristique est partagée par la boîte TATA et l'opérateur ?
Quelle caractéristique est partagée par la boîte TATA et l'opérateur ?
Quel est le rôle principal de l'opérateur dans un génome ?
Quel est le rôle principal de l'opérateur dans un génome ?
Comment est définie la limite entre les régions positive et négative d'un promoteur ?
Comment est définie la limite entre les régions positive et négative d'un promoteur ?
Quel est le rôle de la séquence Shine Dalgarno chez les bactéries ?
Quel est le rôle de la séquence Shine Dalgarno chez les bactéries ?
Quelles caractéristiques distinguent la bulle de transcription de la fourche de réplication ?
Quelles caractéristiques distinguent la bulle de transcription de la fourche de réplication ?
Quel codon représente le début de la traduction chez les bactéries ?
Quel codon représente le début de la traduction chez les bactéries ?
Quelle est la fonction de la protéine Ϭ^32^ dans la transcription ?
Quelle est la fonction de la protéine Ϭ^32^ dans la transcription ?
Dans quelle situation une bactérie synthétise-t-elle des protéines HSP ?
Dans quelle situation une bactérie synthétise-t-elle des protéines HSP ?
Quel est le rôle spécifique de la protéine Ϭ dans la transcription?
Quel est le rôle spécifique de la protéine Ϭ dans la transcription?
Quels sont les 3 phases de la transcription?
Quels sont les 3 phases de la transcription?
Quel est le rôle des exons dans un gène bactérien ?
Quel est le rôle des exons dans un gène bactérien ?
Quelle est la séquence d'ARN dans le sens de la synthèse ?
Quelle est la séquence d'ARN dans le sens de la synthèse ?
Quelle est la différence entre les ponts hydrogènes dans les paires A=T et C≡G?
Quelle est la différence entre les ponts hydrogènes dans les paires A=T et C≡G?
Quelle structure est responsable de la synthèse de l'ARN chez les bactéries ?
Quelle structure est responsable de la synthèse de l'ARN chez les bactéries ?
Quel mécanisme est décrit comme RHO indépendant pour arrêter la transcription?
Quel mécanisme est décrit comme RHO indépendant pour arrêter la transcription?
Quel est l'effet de la séquence palindromique dans la transcription?
Quel est l'effet de la séquence palindromique dans la transcription?
Quel type de promoteur est utilisé dans les gènes polycistroniques ?
Quel type de promoteur est utilisé dans les gènes polycistroniques ?
Pourquoi la polymérase est-elle ralentie lors de l'interaction avec les séquences C≡G?
Pourquoi la polymérase est-elle ralentie lors de l'interaction avec les séquences C≡G?
Quel est le premier acide aminé incorporé lors de la traduction ?
Quel est le premier acide aminé incorporé lors de la traduction ?
Quel est le rôle du terminateur dans le processus de transcription?
Quel est le rôle du terminateur dans le processus de transcription?
Quelles sont les caractéristiques de la protéine RHO dans le mécanisme de transcription?
Quelles sont les caractéristiques de la protéine RHO dans le mécanisme de transcription?
Quelle est la conséquence de la dislocation lors de la transcription?
Quelle est la conséquence de la dislocation lors de la transcription?
Quels mécanismes sont impliqués chez les eucaryotes pour la fin de transcription?
Quels mécanismes sont impliqués chez les eucaryotes pour la fin de transcription?
Les gènes eucaryotes sont généralement polycistroniques.
Les gènes eucaryotes sont généralement polycistroniques.
Le promoteur chez les prokaryotes est également l'endroit où se lie l'ARN polymérase.
Le promoteur chez les prokaryotes est également l'endroit où se lie l'ARN polymérase.
Les activateurs augmentent toujours la transcription des gènes.
Les activateurs augmentent toujours la transcription des gènes.
La région -10 du promoteur est importante uniquement chez les eucaryotes.
La région -10 du promoteur est importante uniquement chez les eucaryotes.
L'ARN polymérase euk est constituée de plusieurs protéines et a un facteur de transcription spécifique lié à la boîte TATA.
L'ARN polymérase euk est constituée de plusieurs protéines et a un facteur de transcription spécifique lié à la boîte TATA.
Un opéron peut contenir plusieurs gènes régulés par un seul promoteur.
Un opéron peut contenir plusieurs gènes régulés par un seul promoteur.
Les enzymes de l'opéron tryptophane ne sont pas essentielles pour la survie des bactéries.
Les enzymes de l'opéron tryptophane ne sont pas essentielles pour la survie des bactéries.
La lecture du brin matrice par l'ARN polymérase se fait de 5' vers 3'.
La lecture du brin matrice par l'ARN polymérase se fait de 5' vers 3'.
Dans un gène polycistronique, il n'y a qu'une seule séquence Shine Dalgarno pour tous les gènes.
Dans un gène polycistronique, il n'y a qu'une seule séquence Shine Dalgarno pour tous les gènes.
La protéine Ϭ^70^ est associée à la réponse au choc thermique chez les bactéries.
La protéine Ϭ^70^ est associée à la réponse au choc thermique chez les bactéries.
La bulle de transcription concerne l'intégralité de l'ADN tout comme la fourche de réplication.
La bulle de transcription concerne l'intégralité de l'ADN tout comme la fourche de réplication.
La position N-terminale d'une protéine est toujours associée au dernier acide aminé de la chaîne polypeptidique.
La position N-terminale d'une protéine est toujours associée au dernier acide aminé de la chaîne polypeptidique.
Les répresseurs chez les bactéries agissent comme inhibiteurs de la traduction.
Les répresseurs chez les bactéries agissent comme inhibiteurs de la traduction.
La boîte TATA chez les eucaryotes est reconnue par la protéine sigma.
La boîte TATA chez les eucaryotes est reconnue par la protéine sigma.
Le promoteur chez les prokaryotes se situe généralement en amont de la région codante.
Le promoteur chez les prokaryotes se situe généralement en amont de la région codante.
Les activateurs de transcription empêchent toujours la fixation de l'ARN polymérase.
Les activateurs de transcription empêchent toujours la fixation de l'ARN polymérase.
L'opérateur est présent dans tous les gènes prokaryotes.
L'opérateur est présent dans tous les gènes prokaryotes.
La région -35 du promoteur est moins essentielle que la boîte TATA pour la reconnaissance de l'ARN polymérase chez les bactéries.
La région -35 du promoteur est moins essentielle que la boîte TATA pour la reconnaissance de l'ARN polymérase chez les bactéries.
Les gènes domestiques sont exprimés de façon intermittente dans toutes les cellules.
Les gènes domestiques sont exprimés de façon intermittente dans toutes les cellules.
La séquence de reconnaissance de la boîte TATA est spécifique à tous les organismes, qu'ils soient prok ou euk.
La séquence de reconnaissance de la boîte TATA est spécifique à tous les organismes, qu'ils soient prok ou euk.
La limite entre les régions négative et positive d'un promoteur est définie par le début du gène.
La limite entre les régions négative et positive d'un promoteur est définie par le début du gène.
Chez Escherichia coli, la présence de la boîte TATA est une homologie de séquence fréquente dans les promoteurs.
Chez Escherichia coli, la présence de la boîte TATA est une homologie de séquence fréquente dans les promoteurs.
Tous les activateurs de transcription chez les eucaryotes agissent en se liant à l'opérateur.
Tous les activateurs de transcription chez les eucaryotes agissent en se liant à l'opérateur.
Les ponts hydrogènes entre A=T sont plus difficiles à casser que ceux entre C≡G.
Les ponts hydrogènes entre A=T sont plus difficiles à casser que ceux entre C≡G.
La protéine Ϭ disparaît au moment de l'initiation de la transcription.
La protéine Ϭ disparaît au moment de l'initiation de la transcription.
Dans la phase de terminaison, un terminateur permet le détachement de l'ARN polymérase.
Dans la phase de terminaison, un terminateur permet le détachement de l'ARN polymérase.
Le mécanisme RHO dépendant implique une protéine RHO ayant une affinité pour des séquences d'ARN bicaténaire.
Le mécanisme RHO dépendant implique une protéine RHO ayant une affinité pour des séquences d'ARN bicaténaire.
Les séquences palindromiques permettent une auto-hybridation et peuvent former une boucle lors de la transcription.
Les séquences palindromiques permettent une auto-hybridation et peuvent former une boucle lors de la transcription.
La phase d'élongation de la transcription implique le déplacement de la bulle de transcription.
La phase d'élongation de la transcription implique le déplacement de la bulle de transcription.
Chez les bactéries, la protéine RHO hexamérique est impliquée uniquement dans le mécanisme RHO indépendant.
Chez les bactéries, la protéine RHO hexamérique est impliquée uniquement dans le mécanisme RHO indépendant.
Les gènes de prot α, β,...Ϭ^70^ sont considérés comme moins courants que Ϭ^32^ et Ϭ^60^.
Les gènes de prot α, β,...Ϭ^70^ sont considérés comme moins courants que Ϭ^32^ et Ϭ^60^.
La transcription est divisée en deux phases principales : initiation et terminaison.
La transcription est divisée en deux phases principales : initiation et terminaison.
L'ARN polymérase a une activité enzymatique d'hélicase qui dénature l'ADN avant la synthèse de l'ARN.
L'ARN polymérase a une activité enzymatique d'hélicase qui dénature l'ADN avant la synthèse de l'ARN.
La plupart des gènes des bactéries sont formés en ______ = train de gènes.
La plupart des gènes des bactéries sont formés en ______ = train de gènes.
L'ARN polymérase chez les prokaryotes est un complexe protéique composé d'éléments ______, β et β'.
L'ARN polymérase chez les prokaryotes est un complexe protéique composé d'éléments ______, β et β'.
1 opéron commence par un ______ avec à proximité un opérateur.
1 opéron commence par un ______ avec à proximité un opérateur.
La séquence d'ARN fabriquée par l'ARN polymérase est appelée ARN ______.
La séquence d'ARN fabriquée par l'ARN polymérase est appelée ARN ______.
Il n'existe ______ type d'ARN polymérase des bactéries.
Il n'existe ______ type d'ARN polymérase des bactéries.
La boîte ______ est une séquence oligo-nucléotidique reconnue par l'ARN polymérase.
La boîte ______ est une séquence oligo-nucléotidique reconnue par l'ARN polymérase.
Chez les eukaryotes, la boîte TATA est reconnue par la protéine ______.
Chez les eukaryotes, la boîte TATA est reconnue par la protéine ______.
L'opérateur joue le rôle d'attirer des activateurs ou ______ de transcription.
L'opérateur joue le rôle d'attirer des activateurs ou ______ de transcription.
Les gènes ______ sont transcrits dans certaines cellules et pas d'autres.
Les gènes ______ sont transcrits dans certaines cellules et pas d'autres.
La région ______ du promoteur est importante pour la reconnaissance par l'ARN polymérase chez les bactéries.
La région ______ du promoteur est importante pour la reconnaissance par l'ARN polymérase chez les bactéries.
La boîte TATA est située en position ______.
La boîte TATA est située en position ______.
La ______ est la partie d'un promoteur qui correspond à la limite entre les régions positive et négative.
La ______ est la partie d'un promoteur qui correspond à la limite entre les régions positive et négative.
Les gènes ______ sont également appelés gènes domestiques ou gènes de maintenance.
Les gènes ______ sont également appelés gènes domestiques ou gènes de maintenance.
La boîte TATA est reconnue chez les prok par la protéine ______.
La boîte TATA est reconnue chez les prok par la protéine ______.
Les activateurs de transcription ______ la transcription d'un gène.
Les activateurs de transcription ______ la transcription d'un gène.
Flashcards
Séquences consensus/conservées
Séquences consensus/conservées
Séquences d'ADN qui n'ont pas ou très peu évolué au cours du temps car elles sont impliquées dans des fonctions essentielles.
Promoteur
Promoteur
Un promoteur est une séquence d'ADN qui permet à l'ARN polymérase de se fixer et d'initier la transcription d'un gène.
Opérateur
Opérateur
Un opérateur est une séquence d'ADN qui contrôle l'accès de l'ARN polymérase au promoteur. Il est généralement situé à proximité du promoteur.
ARN polymérase bactérienne
ARN polymérase bactérienne
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ARN polymérase eucaryote
ARN polymérase eucaryote
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Boîte TATA
Boîte TATA
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Gène
Gène
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Opéron
Opéron
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Promoteur Bis
Promoteur Bis
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Terminateur
Terminateur
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TBP (TATA Binding Protein)
TBP (TATA Binding Protein)
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Activateurs et Inhibiteurs de transcription
Activateurs et Inhibiteurs de transcription
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Gène inductible
Gène inductible
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Gène domestique / Housekeeping gene / Gène constitutif
Gène domestique / Housekeeping gene / Gène constitutif
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Homologie de séquence
Homologie de séquence
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Limite du promoteur
Limite du promoteur
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Séquences privilégiées
Séquences privilégiées
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Le facteur sigma (σ)
Le facteur sigma (σ)
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Le terminateur
Le terminateur
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L'élongation
L'élongation
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L'initiation
L'initiation
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La terminaison
La terminaison
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Le promoteur
Le promoteur
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La protéine Rho
La protéine Rho
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La terminaison Rho-dépendante
La terminaison Rho-dépendante
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La terminaison Rho-indépendante
La terminaison Rho-indépendante
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La liaison hydrogène
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Qu'est-ce qu'un gène polycistronique ?
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Qu'est-ce qu'un opéron ?
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Quelle est la fonction de la séquence Shine-Dalgarno ?
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Qu'est-ce que la transcription ?
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Qu'est-ce que la bulle de transcription ?
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Quel est le codon START ?
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Quel est le codon STOP ?
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Qu'est-ce qu'un répresseur ?
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Quelle est la fonction des protéines Ϭ?
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Qu'est-ce que les protéines de choc thermique (HSP) ?
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ARN polymérase procaryote
ARN polymérase procaryote
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Protéine TBP
Protéine TBP
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Gènes domestiques
Gènes domestiques
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Qu'est-ce qu'un promoteur ?
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Protéines Ϭ (sigma)
Protéines Ϭ (sigma)
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Sous-unités Ϭ^32^ et Ϭ^60^
Sous-unités Ϭ^32^ et Ϭ^60^
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Initiation de la transcription
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Élongation de la transcription
Élongation de la transcription
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Terminaison de la transcription
Terminaison de la transcription
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Terminaison Rho-dépendante
Terminaison Rho-dépendante
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Terminaison Rho-indépendante
Terminaison Rho-indépendante
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Activité d'hélicase et de polymérase de l'ARN polymérase
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Auto-hybridation de l'ARN
Auto-hybridation de l'ARN
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Protéine sigma (Ϭ)
Protéine sigma (Ϭ)
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Ϭ^70^
Ϭ^70^
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Activate
ur de
transcription
Activate
ur de
transcription
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Inhibiteur
de transcription
Inhibiteur
de transcription
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Gène
domestique /
Housekeeping
gene /
Gène
constitutif
Gène
domestique /
Housekeeping
gene /
Gène
constitutif
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Study Notes
Transcription et modifications post-transcriptionnelles
- Promoteur: Séquence d'ADN au début d'un gène, recrutant des enzymes. Contient des régions spécifiques comme la boîte TATA.
- Boîte TATA (ou Pribnow): Située à -10 par rapport à l'initiation de la transcription. Joue un rôle dans la reconnaissance et la fixation de l'ARN polymérase. Elle est similaire dans les procariotes et eucaryotes, mais les protéines impliquées sont différentes. Chez les procaryotes, elle est reconnue par la protéine σ. Chez les eucaryotes, par le facteur TBP.
- Opérateur: Séquence oligo-nucléotidique, souvent proche du promoteur ; attire des activateurs ou inhibiteurs de la transcription. Peut être utilisé comme zone de fixation des activateurs ou inhibiteurs pour réguler la transcription. L'opérateur est souvent situé à proximité immédiate du promoteur.
- Activateurs de transcription: Permettent la régulation de gènes inductibles (exprimés dans certaines cellules seulement) contre les gènes domestiques (toujours actifs). Ils se fixent à l'opérateur ou au promoteur pour faciliter la fixation de l'ARN polymérase. Les activateurs augmentent l'efficacité de la transcription.
- Inhibiteurs de transcription: Empêchent la transcription de certains gènes. Ils se fixent à l'opérateur ou au promoteur pour empêcher la fixation de l'ARN polymérase. Les inhibiteurs diminuent l'efficacité de la transcription.
- Homologies de séquence dans les promoteurs: Les promoteurs des bactéries, quand comparés, présentent des similitudes dans leur séquence, ce qui indique une conservation évolutive. Des séquences consensus sont présentes, tels que TATAAT et la région -35.
- Boîte privilégiée -35: Région du promoteur avec des séquences conservées et importantes lors de la reconnaissance par l'ARN polymérase. Elle est proche d'une séquence consensus.
- Boîte TATA située à -10: Séquence conservée dans les promoteurs pour la reconnaissance par l'ARN polymérase. Elle est située avant le site d'initiation de la transcription. La boîte TATA est essentielle à l'initiation de la transcription.
ARN polymérase prok
- Complexe protéique: L’ARN polymérase procaryote est constituée de plusieurs sous-unités, incluant α, β, β' et σ. La sous-unité σ est importante pour la reconnaissance du promoteur.
- Un seul type d'ARNpol dans les bactéries: Il existe un type principal d'ARN polymérase chez les bactéries.
- Opéron: Plusieurs gènes peuvent être organisés en unité fonctionnelle appelée opéron, contrôlés par un même promoteur. La plupart des gènes bactériens font partie d'opérons, unités de régulation coordonnée de plusieurs gènes.
ARN polymérase euk
- Plusieurs types d'ARNpol: Les eucaryotes possèdent trois types principaux d'ARN polymérases (I, II et III), chacune ayant des rôles spécifiques. L'ARN polymérase II est impliquée dans la transcription des gènes codant pour les protéines, une étape cruciale de la synthèse des protéines.
- Facteurs de transcription (TF): Des facteurs supplémentaires sont requis pour que l'ARN polymérase II transcrive le gène de la protéine. Des complexes de facteurs de transcription (TFII) sont nécessaires pour l'initiation de la transcription chez les eucaryotes, en plus de l'ARN polymérase II.
Particularités de la ou les protéines σ
- Choc thermique: Des protéines σ spécifiques, comme σ32, sont activées en réponse à un choc thermique pour la synthèse de protéines liées au choc thermique.
- Autres stress métaboliques: D'autres facteurs σ sont activés (σ66) lors de stress métaboliques.
- Constitutives vs. régulées: Certaines protéines σ sont constitutionnelles tandis que d'autres sont régulées en fonction des besoins cellulaires. Les protéines σ sont essentielles pour la reconnaissance du promoteur par l'ARN polymérase. Les différentes formes de σ jouent des rôles distincts dans la régulation.
Structure d'un opéron
- Fonction et organisation d'un opéron: Un opéron comprend un promoteur, un opérateur, et un groupe de gènes, tous contrôlés par une seule unité de régulation.
- Opéron lactose et tryptophane: Exemples d'opérons pour la métabolisation du lactose et la synthèse du tryptophane respectivement.
Terminaison de la transcription
- Terminaison indépendante de Rho: Certaines séquences dans l'ADN signalent la terminaison de la transcription sans la participation d'une protéine Rho.
- Terminaison dépendante de Rho: Une protéine appelée Rho est impliquée , provoquant la dissociation de l'ARN polymérase de l'ADN par l'interaction avec l'ARNm naissant. Rho est une protéine qui se lie à l'ARN, facilitant la séparation de l'ARNm nouvellement synthétisé de l'ADN.
- Terminaison dans les eucaryotes: les eucaryotes ont des mécanismes différents de terminaison. Ils sont plus complexes et impliquent souvent des séquences d'arrêt dans la région 3' du gène.
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