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Questions and Answers
Comment sont classées les protéines selon la forme?
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Quel est l'objectif général de la description des protides?
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Décrire les protides et leur fonction
Citez deux objectifs spécifiques liés aux protéines.
Citez deux objectifs spécifiques liés aux protéines.
- Citer les différentes classifications des protéines
- Décrire les différents types de structures des protéines
- Citer les différentes fonctions des protéines
La protéine principale du tissu conjonctif est le ___.
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Les protéines fibreuses sont insolubles.
Les protéines fibreuses sont insolubles.
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Quel est le poids moléculaire de l'insuline?
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Quel est le rôle du glutathion dans le corps humain?
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Quel est le rôle de l'insuline dans le corps?
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Le glucagon est une hormone hyperglycémiante.
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Quel est l'effet de l'ocytocine sur le corps?
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Quelle hormone agit sur le rein en provoquant la rétention d'eau?
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Qui vend plusieurs kilos/an d'ocytocine?
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Quelle hormone stimule la production de thyréostimuline par l'hypophyse?
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Les enképhalines agissent sur les mêmes récepteurs que les opiacés.
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Qu'est-ce que la chiralité des acides aminés?
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Quel acide aminé est capable d'émettre de la fluorescence?
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Les acides aminés neutres ont une propriété amphotère.
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Le pH pour lequel la charge positive est égale à la charge négative d'un acide aminé est appelé le pH __________.
Le pH pour lequel la charge positive est égale à la charge négative d'un acide aminé est appelé le pH __________.
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Que signifie la cristallisation des acides aminés?
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Quel est le rôle de l'histamine dans le corps humain?
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Quel est le rôle de la sérotonine dans l'organisme?
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En quoi consiste le rôle de la noradrénaline dans le système nerveux?
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Quel est le rôle de l'adrénaline dans l'organisme?
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Quel est le rôle de l'acide amino-butyrique dans le corps humain?
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Quelle est la fonction principale de la β-Alanine dans l'organisme?
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Quelle est la fonction de l'élastine dans le corps?
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Que transforme le fibrinogène sous l'action de la thrombine?
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Les protéines musculaires sont responsables des contractions musculaires.
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Quelle protéine est responsable du transport de l'oxygène et du dioxyde de carbone dans le sang? Hém___________
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Associez les types de protéines aux descriptions suivantes:
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Quel est le processus qui consiste en la destruction des structures tridimensionnelles de la protéine tout en respectant sa structure primaire?
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Quels sont quelques-uns des agents dénaturants qui peuvent être utilisés pour dénaturer les protéines? (Sélectionnez tout ce qui s'applique)
Quels sont quelques-uns des agents dénaturants qui peuvent être utilisés pour dénaturer les protéines? (Sélectionnez tout ce qui s'applique)
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Quel type de protéines est le principal matériau de construction chez les Vertébrés?
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La kératine est totalement soluble dans l'eau.
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La présente dans les fibres élastiques est appelée ________.
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Dans la structure primaire des protéines, qu'est-ce qui détermine les propriétés morphologiques et les rôles fonctionnels de la protéine?
Dans la structure primaire des protéines, qu'est-ce qui détermine les propriétés morphologiques et les rôles fonctionnels de la protéine?
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Quel changement spécifique dans la séquence des acides aminés de l'insuline est observé entre différentes espèces?
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Les liaisons hydrogène stabilisent la structure secondaire des protéines.
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Quel type de structure protéique est caractérisé par une hélice serrée avec des radicaux à l'extérieur de l'hélice?
Quel type de structure protéique est caractérisé par une hélice serrée avec des radicaux à l'extérieur de l'hélice?
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Les liaisons _________ entre les radicaux des acides aminés peuvent créer une attraction entre charges de signes différents.
Les liaisons _________ entre les radicaux des acides aminés peuvent créer une attraction entre charges de signes différents.
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Study Notes
Structure des Acides Aminés
Introduction
- Les acides aminés (AA) sont des unités monomériques pour diverses biosynthèses dans l'organisme
- Ils ont divers rôles (fonction structurale, hormonale, catalytique, transmission nerveuse, régulation de la croissance cellulaire, etc.)
- Les AA protéinogènes (21 AA) sont incorporés dans les peptides et protéines
- Les AA impliqués dans des voies métaboliques (ornithine, citrulline, méthyl-histidine, homocystéine, homosérine, etc.)
Structure de Base
- Les acides aminés ont une structure de base commune avec un groupement carboxylique et un groupement amine liés au même carbone α
- La plus fréquemment rencontrée est la forme ionisée
- Selon le pH, la forme majeure change (forme cationique à pH 1, forme zwitterionique à pH 7 et forme anionique à pH 11)
Classification
- Dépendant de la nature du radical R
- Acides aminés neutres (AA aliphatiques et hydroxylés): radical R ni fonction amine ni fonction carboxyle
- Acides aminés acides (ASP, GLU): radical R portant une fonction carboxyle
- Acides aminés basiques (Lys, Arg, His): radical R portant une fonction amine
Acides Aminés Neutres
- Glycine (Gly ou G): radical hydrogène, AA non essentiel
- Alanine (Ala ou A): radical méthyle, AA non essentiel
- Valine (Val ou V): radical isopropyle, AA essentiel
- Leucine (Leu ou L): radical isobutyle, AA essentiel
- Isoleucine (Ile ou I): radical isobutyle ramifié, AA essentiel
- Sérine (Ser ou S): radical alcool primaire, site de phosphorylation
- Thréonine (Thr ou T): radical alcool secondaire, AA essentiel
- Cystéine (Cys ou C): radical thiol, AA non essentiel, forme des ponts disulfures
- Méthionine (Met ou M): radical thioéther, AA essentiel, précurseur métabolique de la S-adénosyl méthionine
- Phénylalanine (Phe ou F): radical noyau benzénique, AA essentiel
- Tyrosine (Tyr ou Y): radical noyau benzénique hydroxylé, AA non essentiel
- Tryptophane (Trp ou W): radical noyau indole, AA essentiel
- Proline (Pro ou P): noyau pyrrolidine, AA essentiel
Acides Aminés Acides
- Aspartate (Asp ou D): radical 1 chaînon carboné et 1 carboxyle, AA non essentiel
- Glutamate (Glu ou E): radical 2 chaînons carbonés et 1 carboxyle, AA non essentiel
- Asparagine (Asn ou N): dérivé de l'ASP, AA non essentiel
- Glutamine (Gln ou Q): dérivé de la GLU, AA non essentiel
Acides Aminés Basiques
- Lysine (Lys ou K): radical formé de 4 chaînons carbonés et une fonction amine, AA essentiel
- Arginine (Arg ou R): radical formé de groupement amidine, AA essentiel
- Histidine (His ou H): radical formé d'1 chaînon carboné et d'un noyau imidazole, AA essentiel
Propriétés Physiques des Acides Aminés
- Configuration: AA de la série L et D (stéréoisomérie)
- Pouvoir rotatoire: propriété optique de déviation de la lumière polarisée
- Solubilité dans l'eau: très variable mais la plupart étant solubles dans l'eau
- Propriété spectrale d'absorption dans l'UV: absorption pour les AA aromatiques, avec un pic à 280nm pour le TRP
- Fluorescence: émission d'une fluorescence à 348nm après soumission à un rayonnement à 278nm uniquement pour le TRP
- Ionisation fonction du milieu: chaque AA ayant un pH pour lequel charge positive égale charge négative (pH isoélectrique ou pI)
- Amphotérie: présence concomitante d'une fonction acide et amine (basique) dans un AA### Acides aminés polaires ionisables
- Chargés négativement à pH neutre : acide aspartique, acide glutamique
- Chargés positivement à pH neutre : lysine, arginine, histidine
Propriétés physiques
- Selon la polarité :
- Apolaires : alanine, valine, leucine, isoleucine, méthionine, phénylalanine, tryptophane, proline
- Le groupement R est à l'origine de la propriété de chaque acide aminé
- Acides aminés basiques : stabilisation des conformations spécifiques des protéines
- Acides aminés chargés négativement : rôle de relais de charge transportant les charges à travers de grandes distances
- Groupement alcool de la sérine et thioalcool de la cystéine : nucléophile
Propriétés chimiques
- Formation d'amide :
- Par liaison entre –COOH d'un acide aminé avec le groupement aminé d'un autre acide aminé
- Liaison peptidique liant les acides aminés entre eux, très stable (hydrolyse nécessitant HCl 6N, 110°C, 24h)
- Décarboxylation :
- Formation d'amines après décarboxylation, dont certaines ont un rôle biologique important
- Exemples : histidine/histamine, tryptophane/tryptamine - sérotonine, tyrosine/tyramine - noradrenaline - adrénaline, acide glutamique/acide amino-butyrique, acide aspartique/β-alanine
Rôles biologiques
- Rôle de l'histamine :
- Phénomènes allergiques
- Vasodilatation artérielle
- Contraction des muscles lisses
- Sécrétion du suc gastrique
- Neurotransmetteur
- Rôle de la sérotonine :
- Vasoconstricteur
- Neurotransmetteur
- Rôle de la noradrenaline :
- Médiateur chimique du système nerveux sympathique
- Neurotransmetteur
- Rôle de l'adrénaline :
- Hormone de la médullo-surrénale
- Vasoconstricteur
- Neurotransmetteur
- Rôle de l'acide amino-butyrique :
- Rôle dans le sommeil
- Rôle du β-alanine :
- Rôle dans la constitution du coenzyme A et de plusieurs peptides
Autres propriétés chimiques
- Estérification par une fonction alcool :
- Protection de la fonction carboxylique lors de la synthèse des peptides
- Formation de chlorure d'acides en présence de pentachlorure de phosphore :
- Formation d'alcool par réduction de la fonction carboxylique
- Désamination :
- Formation d'un acide α-cétonique
- Addition de carbonyle à la fonction amine :
- Réactions réversibles de la fonction amine avec les aldéhydes pour former la base de Schiff
- Réaction d'arylation de la fonction amine :
- Réaction ayant permis à Sanger d'étudier la structure primaire des peptides et protéines
- Acylation de la fonction amine :
- Réaction avec le chlorure de dansyle, stable et fluorescent, ayant permis de mieux étudier la structure primaire
- Carbamylation de la fonction amine :
- Réaction avec le phénylisothiocyanate à un pH à 9, donnant des composés absorbant dans l'ultraviolet, facilement séparable par chromatographie
- Libération d'un acide aminé et reste du peptide amputé de son acide aminé N-terminal### PROPRIÉTÉS CHIMIQUES DES ACIDES AMINÉS
- Réaction de diazotation avec l'oxyde nitreux
- Réactions de transamination :
- Transfert direct d'une fonction amine sur un acide cétonique
- Intervention des transaminases ou amino-transférases
RÔLES BIOLOGIQUES DES ACIDES AMINÉS
- Rôle structural :
- Structure de base des protéines et peptides
- Création de ponts inter-chaînes et intra-chaînes par le groupement thiol de la cystéine
- Acides aminés essentiels (8) :
- Ne peuvent pas être synthétisés par l'organisme
- Apport obligatoire par l'alimentation
- Si absence, apparition de troubles graves pouvant être létaux
- Seuls une vingtaine d'acides aminés entrent dans la formation des protéines (acides aminés protéinogènes)
- Les autres : acides aminés non protéinogènes
ROLES BIOLOGIQUES DES ACIDES AMINÉS
- Rôle de tampon du pH sanguin :
- Empêche les variations du pH sanguin (7,35 – 7,42)
- Capture des ions H+ si acidification du milieu
- Capture des ions OH-/ libération de l'ion H+ de la fonction COOH si alcalinisation du milieu
- Rôle énergétique
- Rôle métabolique (précurseur de molécules d'intérêt biologique ou intermédiaires métaboliques)
LES PEPTIDES
- Définition : formés par des acides aminés liés par une liaison peptidique
- Lecture d'un peptide :
- Extrémité N-terminale : acide aminé porteur d'une amine libre –NH2
- Extrémité C-terminale : acide aminé porteur d'un carboxyle libre –COOH
- Lecture d'un peptide à partir de l'extrémité –NH2 (numérotation de gauche à droite)
- Méthodes d'hydrolyse des peptides :
- Méthodes chimiques (bromure de cyanogène, hydroxylamine, etc.)
- Méthodes enzymatiques (trypsine, chymotrypsine, etc.)
PROPRIÉTÉS DES PEPTIDES
- Solubilité dans l'eau en fonction de la richesse en acides aminés hydrophiles
- Charge en fonction des charges des groupements ionisables des chaînes latérales des acides aminés
- Propriétés de migration sur un champ électrique
- Absorption dans l'UV si contenant un acide aminé aromatique
LES PRINCIPAUX PEPTIDES
- Glutathion :
- Séquence en acides aminés très importante
- Rôle dans le processus d'oxydo-réduction
- Protection de la vitamine C
- Protection des sites actifs des enzymes à –SH
- Insuline :
- Poids moléculaire de 5700
- Glycopeptide dont la structure comporte 2 chaînes
- Rôle : hormone hypoglycémiante
- Glucagon :
- Hormone polypeptidique pancréatique, hyperglycémiante
- Structure monocaténaire (=1 chaîne), formée de 29 acides aminés
- Hormones hypophysaires :
- Ocytocine : rôle dans la contraction utérine
- Vasopressine ou ADH (hormone anti-diurétique) : diminution de l'excrétion d'eau dans les urines
- Nonapeptides (9 acides aminés), même structure, sauf pour les acides aminés en position 2 et 7
- Autres :
- ACTH (adreno-cortico-trophin hormone) : stimulation de la sécrétion des corticostéroïdes par le cortex surrénalien
- Enképhalines : neuropeptides endogènes découverts par Hughes et Kosterlitz en 1975
- Thyrotropin Releasing Factor : peptide produit par les cellules de l'hypothalamus qui stimule la production de thyroïdienne par l'hypophyse
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Description
Découvrez les acides aminés et leur structure, y compris les peptides et les protéines. Comprendre les concepts clés de la structure des acides aminés.