RNA Sequencing Analysis

Qual è il tipo di microarray che utilizza la sintesi fotolitografica?

Quale enzima taglia l'ibrido DNA?

Che cos'è il fattore di proporzionalità nel calcolo dell'espressione genica?

Perché è necessario l'arricchimento o degradazione dell'rRNA durante l'analisi dell'espressione genica?

Che cosa rappresenta l'indice FPKM?

Qual è il vantaggio dell'utilizzo di microarray ad alta densità di oligonucleotidi?

Quanto è il numero minimo di sequenze necessarie per ogni campione sequenziato dal punto di vista del RNA?

Qual è lo scopo del crosslinking con la formaldeide?

Quale fattore influenza l'analisi del dato di espressione genica?

Perché è importante trovare il giusto compromesso tra numero di repliche e numero di pazienti?

Cosa si ottiene dopo aver 'cross-linkato' il nucleo e aver tagliato le parti rimaste singole?

Cosa succede se il campione non è sufficientemente coperto?

Quale è il nome del metodo che consente di studiare solo una regione verso un'altra?

Quale problema deve essere evitato durante l'analisi del dato di espressione genica?

Perché si utilizzano dei primers noti nel metodo 3C?

Cosa si ottiene dopo aver revertito il cross-linking?

Perché è più facile identificare l'espressione di geni abbondantemente espressi?

Quale è il vantaggio del metodo 3C?

Che cosa determina l'acetilazione degli istoni?

Qual è la funzione delle istone acetiltransferasi?

Cosa rappresenta l'iper-metilazione degli istoni?

Che cosa sono gli erasers?

Cosa fanno le proteine readers?

Quale tipo di modifiche subiscono le proteine istoniche?

Qual è il ruolo epigenetico degli RNA-non codificanti?

In che modo gli istoni influenzano la struttura del DNA?

Che cosa si verifica quando il DNA passa da uno stato di estrema compattazione a uno stato rilassato?

Che cos'è la metilazione nel DNA?

Perché l'iper-metilazione delle citosine può impedire l'espressione del gene?

Che cosa sono le isole-CpG?