30 Questions
Qual è il tipo di microarray che utilizza la sintesi fotolitografica?
Microarray ad alta densità di oligonucleotidi
Quale enzima taglia l'ibrido DNA?
RNAsi-H
Che cos'è il fattore di proporzionalità nel calcolo dell'espressione genica?
15 milioni diviso 1.000.000
Perché è necessario l'arricchimento o degradazione dell'rRNA durante l'analisi dell'espressione genica?
Per evitare che l'rRNA ribosomiale abbia un impatto negativo sull'analisi
Che cosa rappresenta l'indice FPKM?
Il numero di reads per kilobase per milione di reads
Qual è il vantaggio dell'utilizzo di microarray ad alta densità di oligonucleotidi?
Permette di analizzare un numero maggiore di geni
Quanto è il numero minimo di sequenze necessarie per ogni campione sequenziato dal punto di vista del RNA?
20 milioni di sequenze
Qual è lo scopo del crosslinking con la formaldeide?
Fissare le interazioni tra proteine e DNA
Quale fattore influenza l'analisi del dato di espressione genica?
La lunghezza del trascritto
Perché è importante trovare il giusto compromesso tra numero di repliche e numero di pazienti?
Per garantire un coverage adeguato del campione
Cosa si ottiene dopo aver 'cross-linkato' il nucleo e aver tagliato le parti rimaste singole?
Porzioni di DNA attaccate alle proteine
Cosa succede se il campione non è sufficientemente coperto?
Il campione non potrà essere considerato attendibile
Quale è il nome del metodo che consente di studiare solo una regione verso un'altra?
Metodo one-to-one
Quale problema deve essere evitato durante l'analisi del dato di espressione genica?
Tutti i sopra
Perché si utilizzano dei primers noti nel metodo 3C?
Per cercare le regioni che interagiscono
Cosa si ottiene dopo aver revertito il cross-linking?
Molecole di DNA lineari
Perché è più facile identificare l'espressione di geni abbondantemente espressi?
Perché sono più facilmente coperti dalle sequenze
Quale è il vantaggio del metodo 3C?
Consente di studiare solo una regione verso un'altra
Che cosa determina l'acetilazione degli istoni?
Un distaccamento delle istone dal filamento di DNA
Qual è la funzione delle istone acetiltransferasi?
Aggiungere i gruppi acetilici agli istoni
Cosa rappresenta l'iper-metilazione degli istoni?
Una repressione trascrizionale
Che cosa sono gli erasers?
Enzimi che rimuovono modifiche epigenetiche
Cosa fanno le proteine readers?
Interpretano i segnali epigenetici
Quale tipo di modifiche subiscono le proteine istoniche?
Modifiche post-traduzionali
Qual è il ruolo epigenetico degli RNA-non codificanti?
Modulano l'espressione dei geni
In che modo gli istoni influenzano la struttura del DNA?
Avvolgendo il DNA in una struttura compatta
Che cosa si verifica quando il DNA passa da uno stato di estrema compattazione a uno stato rilassato?
L'espressione dei geni
Che cos'è la metilazione nel DNA?
La modifica delle citosine in specifiche regioni del DNA
Perché l'iper-metilazione delle citosine può impedire l'espressione del gene?
Perché blocca la trascrizione del gene
Che cosa sono le isole-CpG?
Regioni del DNA che contengono pattern CpG
Learn how to analyze RNA sequencing data effectively, considering the limitations of sequencing platforms and the required number of sequences for reliable results.
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