Molekulinė biologija: RNR sintezė ir translacija

Esminis ląstelių mechanizmas užtikrinantis DNR vientisumą ir stabilumą, pašalinant pažaidas, atsiradusias dėl įvairių veiksnių, pvz., radiacijos, cheminių medžiagų.

DNR molekulės pažaidos, atsirandančios dėl įvairių veiksnių, pvz., radiacijos ar cheminio poveikio.

DNR fragmentavimas į dvi dalis, dviguba sruogos plyšimas, labai pavojinga pažaidos rūšis.

DNR molekulėje esančių bazių pakitimas, pvz., citozino virtimas uracilu.

DNR reparacijos procesas, pašalinantis replikacijos klaidas, kai neteisingai susijungia nukleotidai.

DNR reparacijos būdas, pašalinantis pažaidas be grandinės nutraukimo, naudojantis specialiais fermentais.

DNR reparacijos būdas, pašalinantis viengrandžius pažeidimus, pvz., oksiduotas bazes, palyginti su nukleotidų iškirpimo reparacija, kuri pašalina didesnius fragmentus.

DNR reparacijos procesas, pašalinantis didesnius pažeidimus, pvz., UV spindulių sukeltus timino dimerus.

Pagrindinis fermentas, atsakingas už DNR replikaciją, jis sintetina naują DNR grandinę, naudodamas esamą DNR grandinę kaip šabloną.

Procesas, kurio metu pirminis RNR transkriptas (pre-RNR) virsta subrendusia funkcionalia RNR molekule.

Naudojant DNR šabloną, RNR polimerazė sintetina RNR molekulę.

RNR sekos, kurios pašalinamos iš pre-tRNR, kad ji galėtų subręsti.

Pre-tRNR dalys, kurios pašalinamos, kad susidarytų funkcionali tRNR.

DNR polimerazių mechanizmas, kuris mažina replikacijos klaidų skaičių.

Ribosomų RNR, esanti prokariotuose.

Ribosomų RNR (rRNR) sintezė prasideda nuo pirminio transkripto, kuris yra 30S rRNR. Šis transkriptas yra suskaidomas RNazės III fermentu į atskiras rRNR molekules. Tada vyksta papildomas apdorojimas, įskaitant 5' ir 3' galų apdorojimą endoribonukleazių ir egzoribonukleazių pagalba, kol rRNR tampa funkcionali.

Eukariotų ribosomos turi keturis skirtingus rRNR: 18S, 28S, 5S ir 5.8S. 18S, 28S ir 5.8S rRNR sintezė yra vykdoma RNR polimerazės I, o 5S - RNR polimerazės III.

Intronų pašalinimas ir egzonų sujungimas į vientisą funkcionalią iRNR molekulę. Splaisingą atlieka splaisosoma, kuri yra sudaryta iš penkių snRNP kompleksu, atpažįstančių intronų ribas.

Prieš transliaciją, pre-iRNR molekulė patiria keletą modifikacijų. Prie 5' galo prijungiamas guanozinas (kepurės struktūra) ir 3' gale - poli(A) uodega. Šios modifikacijos apsaugo iRNR nuo degradacijos ir palengvina transliacijos pradedą.

Kai iRNR sintezuojama, jos dalys, vadinamos intronais, yra pašalinamos iš molekulės, o likusi dalis, vadinama egzonais, yra sujungiama. Tačiau kartais skirtingos egzonų kombinacijos gali būti sujungtos į vieną iRNR, taip sukuriant įvairesnę funkciją. Šis procesas vadinamas alternatyviuoju splaisingu.

tRNR modifikacijos, kaip ribozių metilinimas, stabilizuoja jų erdvinę struktūrą ir užtikrina normalų jų funkciją transliacijos metu.

Ribozių metilinimas padidina RNR hidrofobiškumą ir stabilumą, o uridino izomerizacija keičia RNR struktūrą ir prisideda prie ribosomų funkcionalumo.

Procesas, kurio metu pagal DNR matricą sintetinama jai komplementari RNR molekulė.

RNR, komplementari nekoduojančiai DNR grandinei, vietoje timino (T) turi uracilą (U).

DNR sritis, prie kurios jungiasi RNR polimerazė ir kiti baltymai, signalizuojanti, kur turi prasidėti transkripcija.

RNR polimerazė susiduria su DNR seka, signalizuojančia, kad transkripcija turi baigtis.

RNR polimerazės ir transkripcijos veiksnių jungimasis prie promotoriaus, pradedant transkripcijos burbulo susidarymą.

RNR polimerazė juda išilgai DNR, sintetindama RNR transkriptą, DNR ir RNR sudaro laikinus ryšius.

DNR išsiskiria, atidengiant sritį, kur vyks RNR sintezė. RNR polimerazė sintetina RNR, naudodama DNR matricą. Gautas produktas yra identiškas DNR koduojančiai grandinei, pakeičiant timiną uracilu.

Baltymai, kurie veikia chromatino struktūrą, leidžiant genams būti aktyvuotiems.

Baltymai, kurie lenkia DNR, kad suartintų transkripcijos komponentus ir palengvintų reguliavimo baltymų sąveiką.

Baltymai, kurie slopina genų raišką blokuodami aktyviklių prisijungimą prie promotorių.

DNR sekos, stiprinančios arba slopindamos transkripciją, netgi esančios toli nuo promotoriaus.

Trumpi DNR sekos, atpažįstamos specifinių aktyviklių, reaguojant į specifinius signalus (pvz., hormonai ar stresiniai veiksniai).

Mažosios RNR, kurios slopina transliaciją arba skatina iRNR skilimą, prisijungdamos prie komplementarių sekų iRNR.

Procesas, kai mažosios RNR reguliuoja genų raišką, pavyzdžiui, slopindamos specifines iRNR molekules.

Ribosomos dalis, atsakinga už naujos tRNR prisijungimą prie ribosomos.

Ribosomos dalis, atsakinga už augančios polipeptidinės grandinės laikymą.

Ribosomos dalis, kur tRNR išeina iš ribosomos.

Transliacijos etapas, kai mažasis ribosomos subvienetas jungiasi prie iRNR ir pradeda ribosomos formavimąsi.

Transliacijos etapas, kai nauja aminoacil-tRNR prisijungia prie A srities, o peptidiltransferazės centras katalizuoja amino rūgščių sujungimą.

Transliacijos etapas, kai pasiekiamas STOP kodonas, ribosomos atjungia nuo iRNR ir baltymas atlaisvinamas.

Kelių ribosomų kompleksas, kuris vienu metu sintetina kelis baltymus iš vienos iRNR molekulės.

Procesas, kurio metu ribosomos ir iRNR jungiasi ir formuoja funkcinį kompleksą.