Molecular Biology and Genome of Plants - Chapter 1

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Study Flashcards

Questions and Answers

Quelle est la taille du génome de la Liliacée?

100.10^9 pb

Quelle est la stratégie la plus courante pour trouver un gène?

Attribution du gène à un chromosome - cartographie précise du gène sur le chromosome - clonage du gène

Qu'est-ce que la macrosyntenie chez les céréales?

Un alignement conservé de gènes ou de séquences génomiques chez différentes céréales.

Qu'est-ce que la synténie?

<p>Un alignement conservé de gènes ou de séquences génomiques entre différentes espèces.</p> Signup and view all the answers

Qu'est-ce que l'analyse comparative des génomes permet de mettre en évidence?

<p>La macrosyntenie chez les légumineuses et les céréales.</p> Signup and view all the answers

Quelles sont les caractéristiques des plantes modèles?

<p>Génomes simple et petit, représentant d’un large éventail de plantes, outils disponibles, ressources</p> Signup and view all the answers

Pourquoi Arabidopsis thaliana est-elle considérée comme une plante modèle?

<p>Génome de 157 millions de bases, 5 chromosomes, 25000-30000 gènes avec 9 % fonction connue, 60 % fonction prédite et ≈30 % fonction inconnue, dicotylédone modèle</p> Signup and view all the answers

Quelles sont les caractéristiques du riz en tant que plante modèle?

<p>Génome de 450 millions de bases, 12 n, 50000-60000 gènes, plante modèle et plante cultivée, appartient à une famille agronomiquement importante</p> Signup and view all the answers

Quelles sont les caractéristiques des légumineuses Medicago et Lotus en tant que plantes modèles?

<p>Génomes de 454 à 526 millions de bases pour Medicago, 472 millions de bases pour Lotus, appartiennent à une famille agronomiquement importante, génomes en cours de séquençage</p> Signup and view all the answers

Pourquoi le peuplier est-il considéré comme un arbre modèle?

<p>Génome de 480 millions de bases, n = 19, séquençage systématique de 45000 gènes, modèle pour les ligneux</p> Signup and view all the answers

Quelle est la stratégie la plus courante pour trouver un gène?

<p>Attribution du gène à un chromosome, cartographie précise du gène sur le chromosome, clonage du gène</p> Signup and view all the answers

Quelle serait la taille du génome d'une Liliacée?

<p>100.10^9 pb</p> Signup and view all the answers

Qu'est-ce que la synténie?

<p>Recherche d'un gène chez une espèce par synténie</p> Signup and view all the answers

Qu'est-ce que la macrosyntenie chez les céréales?

<p>Analyse comparative des génomes des céréales pour mettre en évidence des blocs de synténie</p> Signup and view all the answers

Qu'est-ce que l'analyse comparative des génomes permet de mettre en évidence?

<p>Elle permet de mettre en évidence la macrosyntenie chez les céréales et les légumineuses</p> Signup and view all the answers

Quelle est la taille du génome d'Arabidopsis thaliana?

<p>157 millions de bases</p> Signup and view all the answers

Combien de gènes Oryza sativa (Riz) possède-t-il?

<p>50000-60000 gènes</p> Signup and view all the answers

Quelle est la particularité des légumineuses Medicago et Lotus en tant que plantes modèles?

<p>Appartiennent à une famille très importante agronomiquement</p> Signup and view all the answers

Quelle est la taille du génome du Peuplier?

<p>480 millions de bases</p> Signup and view all the answers

Qu'est-ce que la macrosyntenie chez les céréales?

<p>3 génomes entièrement séquencés (2 lignées japonica, 1 lignée indica)</p> Signup and view all the answers

Study Notes

Génome des plantes

  • Le génome de la Liliacée est environ de 30-40 Gb.
  • La stratégie la plus courante pour trouver un gène est l'analyse comparative des génomes.

Synténie et macrosyntenie

  • La synténie est la conservation de l'ordre des gènes entre les espèces.
  • La macrosyntenie est la conservation de l'ordre des gènes sur de grandes régions chromosomiques, souvent observée chez les céréales.

Analyse comparative des génomes

  • L'analyse comparative des génomes permet de mettre en évidence les régions conservées entre les espèces, les génomes et les familles de gènes.
  • Cette analyse permet de comprendre l'évolution des génomes et des gènes.

Plantes modèles

  • Les plantes modèles sont des espèces végétales étudiées en détail pour comprendre les mécanismes biologiques fundamentaux.
  • Les caractéristiques des plantes modèles incluent une petite taille, une génération courte, une facilité de culture et une séquence de génome disponible.

Arabidopsis thaliana

  • Arabidopsis thaliana est considérée comme une plante modèle due à sa petite taille, sa génération courte et sa facilité de culture.
  • Le génome d'Arabidopsis thaliana est environ de 157 Mbp.
  • Arabidopsis thaliana est une plante modèle pour l'étude de la biologie des plantes.

Riz (Oryza sativa)

  • Le génome du riz comporte environ 37 000 gènes.
  • Le riz est une plante modèle pour l'étude de la biologie des céréales.

Légumineuses (Medicago et Lotus)

  • Les légumineuses Medicago et Lotus sont considérées comme des plantes modèles pour l'étude de la symbiose avec les bactéries fixatrices d'azote.
  • La particularité des légumineuses Medicago et Lotus est leur capacité à fixer l'azote de l'air grâce à leur association avec des bactéries.

Peuplier

  • Le génome du peuplier est environ de 550-600 Mbp.
  • Le peuplier est considéré comme un arbre modèle pour l'étude de la biologie des arbres.

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