Genregulering i E.coli og Epigenetikk

Lac-operon genregulering i E.coli

• I en løsning uten sukker: cAMP-CRP/CAP fungerer som aktivator, men lac-repressoren binder til operatorområdet
• I en laktose løsning: Allo-laktose binder til lac-repressoren, og den dissosierer fra operatorområdet. Transkripsjonen av lac-operonet foregår maksimalt.
• I en løsning med både laktose og glukose: Allo-laktose binder til lac-repressoren, og den dissosierer fra operatorområdet. Glukose er til stede, så cAMP-nivået er lavt. Lite cAMP binder seg til CRP/CAP aktivatoren. Det blir derfor liten eller ingen transkripsjon av lac-operonet.

Kortisol-binding til glukokortikoid-reseptor

• Steroidhormonbinding til kjernereseptor induserer en konformasjonsforandring som muliggjør transport inn i kjernen.
• Kortisol binder seg til reseptorbindingsetet (hormonrespons element) og koaktivatorproteiner.

Epigenetikk

• Epigenetikk er læren om arvbare, reversible endringer i genaktivitet uten at rekkefølgen på DNA-sekvensen endrer seg.

Michaelis-Menten ligningen og enzymkinetikk

• Vmax er den maksimale reaksjonshastigheten for en enzymkatalysert reaksjon. Den oppnås når alle enzymets aktive seter er mettet med substrat.
• Km er substratmengden som gir en reaksjonshastighet som er halvparten av Vmax. Km representerer substratkonsentrasjonen hvor halvparten av enzymets aktive seter er mettet.

Hemoglobin og myoglobin

• Hemoglobin er et tetramert protein bestående av fire underenheter: to alfa og to beta kjeder.
• Myoglobin er et monomerisk protein med en enkelt polypeptidkjede.
• Hemoglobin er laget for effektiv oksygentransport i blodet. Myoglobin er laget for oksygenoppbevaring i muskelvev.
• Begge proteinene inneholder heme-grupper som binder oksygen.
• Hemoglobin har kooperativ binding av oksygen, og kan dermed binde og frigjøre oksygen effektivt i lungene og vevene.
• Myoglobin har ikke kooperativ binding, og egner seg derfor til oksygenoppbevaring i muskelceller.

DNA og RNA

• DNA er dobbelttrådet, mens RNA er enkelttrådet.
• DNA inneholder sukkeret deoksyribose og basene tymine, cytosine, adenine og guanine.
• RNA inneholder sukkeret ribose og basen uracil i stedet for tymine.

Hovedtyper RNA i eukaryote celler

• mRNA (messenger RNA)
• tRNA (transfer RNA)
• rRNA (ribosomal RNA)
• SnRNA (small nuclear RNA)
• miRNA (micro RNA)
• si RNA (small interfering RNA)

Regulering av proteinsyntese

• Degradering av mRNA
• Translasjonskontroll
• Proteinaktivitet (aktiv/inaktiv/fosforylert/ufosforylert)
• Degradering av protein

Okazaki-fragmenter

• Okazaki-fragmenter er stykker av DNA som lages diskontinuerlig under DNA-replikasjon.
• De blir skjøtet sammen av enzymet DNA ligase.
• Ledertråden ("leading strand") lages kontinuerlig og behøver ikke å skjøtes.

Denne quizen dekker lac-operon genregulering i E.coli, inkludert effekten av sukker og laktose. I tillegg vil den ta for seg kortisol-binding til glukokortikoid-reseptorer og grunnleggende prinsipper for epigenetikk. Test kunnskapene dine om disse viktige biologiske konseptene!