Genetika: Tříbodový test

Podcast

Play an AI-generated podcast conversation about this lesson

Questions and Answers

Jaký je hlavní účel tříbodového testu?

Určení počtu genů v chromozomu.

Určení vzájemného pořadí a vzdáleností mezi třemi lokusy. (correct)

Identifikace mutací v DNA.

Analýza genové exprese.

Proč je tříbodový test výhodnější než dvoubodový test v genetickém mapování?

Zajišťuje lepší kontrolu kvality dat.

Je méně náročný na čas a zdroje.

Je schopný identifikovat více genových mutací.

Poskytuje větší přesnost a vyžaduje menší počty jedinců. (correct)

Jak se stanovuje pořadí lokusů při tříbodovém testu?

Podle počtu mutací.

Podle počtu jedinců v potomstvu.

Podle počtu chromozomů.

Podle četnosti rekombinací gamet. (correct)

Co vyjadřuje koeficient koincidence (C)?

Poměr mezi očekávanou a pozorovanou četností křížení. (D) Signup and view all the answers

Jaký je vztah mezi koeficientem koincidence (C) a interferencí (I)?

I = 1 - C (D) Signup and view all the answers

Proč se používají mapovací funkce při rekombinačním mapování?

Pro opravu zkreslení způsobené vícenásobnými rekombinacemi. (B) Signup and view all the answers

Do jaké vzdálenosti se obvykle mapovací funkce nepoužívají při rekombinačním mapování?

Do 7-10 cM. (C) Signup and view all the answers

Jaký je efekt interference na rekombinaci v chromozómu?

Interference omezuje rekombinaci v sousedních oblastech. (B) Signup and view all the answers

Jaká je hlavní charakteristika genetického polymorfismu v populaci?

Přítomnost dvou nebo více alel téhož lokusu s frekvencí > 1%. (B) Signup and view all the answers

Který typ DNA polymorfismu je charakterizován změnou jediného nukleotidu?

Jednonukleotidové polymorfismy (SNPs). (D) Signup and view all the answers

Jak se liší jednoduchý a vícealelický polymorfismus?

Vícealelický má jednu referenční a více alternativních alel, zatímco jednoduchý má jednu referenční a jednu alternativní alelu. (B) Signup and view all the answers

Které z následujících procesů nejčastěji vedou ke vzniku DNA polymorfismů?

Chyby při replikaci DNA a rekombinaci. (C) Signup and view all the answers

Jaké typy DNA markerů jsou typicky používány při rekombinačním mapování u eukaryot?

Hlavně SNPs (jednonukleotidové polymorfismy) a indels (inzerční/deleční polymorfismy). (B) Signup and view all the answers

Jaká je role mapy DNA markerů v lokalizaci genu?

Mapa DNA markerů slouží jako referenční místa, ke kterým se mapují hledané geny. (A) Signup and view all the answers

Co se určí během přípravy rekombinační mapy na základě rekombinačních frekvencí?

Vzájemná poloha a relativní vzdálenosti markerů. (B) Signup and view all the answers

Které z následujících tvrzení platí pro polymorfismy počtu kopií (CNVs)?

Variabilní počet kopií segmentů o velikosti ~ 200-2 milióny bp. (B) Signup and view all the answers

Study Notes

Tříbodový test

Určuje pořadí a vzájemnou vzdálenost tří lokusů současně.
Je přesnější než dvoubodový test.
Vyžaduje méně jedinců a je méně pracné.
Provádí se v rámci jednoho křížení.
Nejdříve se určí pořadí lokusů (3 možnosti), poté relativní vzdálenosti mezi nimi pomocí rekombinační frekvence (Morganova čísla). Při výpočtu se zohledňují i dvojité rekombináty.

Pojetí Interference a Koeficientu Koincidence

Rekombinaci v jedné oblasti chromozomu brání rekombinaci v sousedních oblastech (crossing-over interference).
Kvantifikace interference se provádí pomocí koeficientu koincidence (C).
C = (pozorovatelná četnost dvojitých rekombinací) / (teoreticky očekávaná četnost dvojitých rekombinací)
Hladina interference (I) = 1 - C
Interference ovlivňuje přesnost rekombinačního mapování. Vysoká interference vede k nižší přesnosti.

Použití mapovacích funkcí

Přesnost mapování se s rostoucí vzdáleností mezi lokusy snižuje.
Mapovací funkce slouží k opravě vzdáleností.
Mapovací funkce se používají u vzdáleností nad 7-10 cM.

DNA polymorfizmy

DNA polymorfizmus je existence dvou nebo více alel stejného lokusu v populaci s frekvencí výskytu >1% (nebo >10%, v některých zdrojích).
Rozdíl od mutací.
Existují různé typy polymorfismů:
- Jednoduché (1 referenční alela, 1 alternativní alela)
- Vícealelické (1 referenční alela, více alternativních alel)
- Jednonukleotidové polymorfizmy (SNPs) - změna 1 báze
- Inserční/deleční polymorfizmy (indels) - změny 1-100 bází
- Polymorfizmy počtu kopií (CNVs) - variabilní počet kopií velkých segmentů (~ 200-2 miliony bází)
- Jiné strukturní varianty

DNA markery a rekombinační mapování

Hlavní typy DNA markerů pro rekombinační mapování u eukaryot:
- Jednonukleotidové polymorfizmy (SNPs) (včetně RFLP markerů)
- Inserční/deleční polymorfizmy (indels, STRs, VNTRs)

Mapa DNA markerů

Mapa DNA markerů se připravuje:
- Identifikací DNA polymorfismů vhodných jako markery.
- Přípravou mapovací populace (podobné zpětnému křížení).
- Určením vztahů mezi markery na základě nerekombinačních frekvencí.
Mapa DNA markerů se pak používá k lokalizaci genů.

Studying That Suits You

Use AI to generate personalized quizzes and flashcards to suit your learning preferences.

Description

Tento kvíz se zaměřuje na tříbodový test v genetickém mapování. Zkoumá, jak se stanovuje pořadí lokusů, význam koeficientu koincidence a vztah mezi interferencí a rekombinací. Odpovědi na tyto otázky vám pomohou lépe pochopit fungování genetického mapování.