27 Questions
Quel événement s'est produit en 1957 dans le contexte de l'évolution des connaissances et des techniques?
Premier symposium EM
Quelles méthodes sont associées à l'isolement sur milieux de culture?
PCR
Quel domaine est associé à la metatranscriptomique?
ARN environnemental
Quel groupe bactérien est associé au soufre?
Thermus/Deinococcus
Quelle méthode est associée à la biologie génomique informatique?
Bio-informatique
Quel événement s'est produit en 1998 dans le contexte de l'évolution des connaissances et des techniques?
'1st ISME'
Quel domaine est associé à la protéomique environnementale?
Protéines environnementales
'Metagenomics' est principalement associé à l'étude de:
'ADN environnemental'
'Populations cultivables' est principalement associé à:
'Relation diversité génétique - fonction'
Qu'est-ce que l'analyse des acides gras phospholipidiques (PLFA) permet de mesurer?
Les biomarqueurs lipidiques
Quelle méthode est utilisée pour mesurer la minéralisation du carbone et de l'azote apporté dans un substrat?
Mesures isotopiques du carbone 13C
Quel est l'objectif de la mesure du rapport 13C/12C en IRMS?
Connaître la source de carbone utilisée par les microorganismes
Quelle technique permet l'estimation microbienne de la biodiversité en mesurant le Carbone microbien?
Analyse des acides gras phospholipidiques (PLFA)
Qu'est-ce que la technique DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) permet d'étudier?
La structure des communautés microbiennes
Quels puits sont inoculés dans la méthode Biolog® Ecoplate?
Puits contenant des substrats carbonés différents
Qu'est-ce que l'empreinte moléculaire permet d'étudier?
La structure des communautés microbiennes
Quelle est la phase où le nombre de copies d'ADN double à chaque cycle dans la qPCR?
Phase exponentielle
Qu'est-ce que la mesure du supplément de carbone ou d'azote minéralisé permet d'estimer?
L'activité métabolique des microorganismes
Quelle méthode est utilisée pour l'extraction de l'ADN du sol dans les études sur les communautés microbiennes du sol?
PCR avec des amorces ciblant Mycobacterium
Quelle technique est utilisée pour l'analyse des plasmides dans les études sur les communautés microbiennes du sol?
Whole genome shotgun
Quelle méthode est utilisée pour relier la diversité et la fonction dans les études sur les communautés microbiennes du sol?
Stable-Isotope Probing (SIP)
Quelle méthode est utilisée pour l'identification in situ des bactéries dans les études sur les communautés microbiennes du sol?
FISH (fluorescent in situ hybridization)
Quelle technique est utilisée pour l'analyse comparative des méthodes omiques dans les études sur les communautés microbiennes du sol?
Metabarcoding
Quelle méthode est utilisée pour l'analyse de la diversité des plantes dans les études sur les communautés microbiennes du sol?
Metabarcoding
Quelle méthode est utilisée pour la comparaison des propriétés de diverses classes de phylum dans les sols traités dans les études sur les communautés microbiennes du sol?
Comparaison des effets de différents traitements de sols
Quelle méthode est utilisée pour l'étude de l'impact de la diversité des plantes sur les communautés mycorhiziennes dans les études sur les communautés microbiennes du sol ?
Analyse par TRFLP (terminal restriction fragment length polymorphism)
Quelle méthode est utilisée pour l'étude de l'impact des vers de terre sur les communautés microbiennes dans le sol ?
Etude de l'impact de diversité des plantes et des vers de terre sur le sol nu et le sol cultivé
Study Notes
- Extraits d'articles relatifs à l'étude des communautés microbiennes du sol par des méthodes omiques : Cheung et al, 2005 ; Johnston et al, 2003 ; Kersanté et al, 2006 ; Lerch, 2010.
- Extraction de l'ADN du sol par PCR avec des amorces ciblant Mycobacterium (Cheung et al, 2005) ou mycorrhizes (Johnson et al, 2003) et analyse par TRFLP (terminal restriction fragment length polymorphism) ou RISA (ribosomal intergenic spacer analysis).
- Étude de l'impact de la diversité des plantes sur les communautés mycorhiziennes et des vers de terre sur les communautés microbiennes.
- Analyse des plasmides, séquençage, comparaison avec des bases de données et construction d'arbres phylogénétiques.
- Quantification des microorganismes par PCR quantitative (qPCR) ou reverse transcription PCR (RT-PCR), mesure de l'abondance d'ARN synthétisé par des bactéries actives dans le sol.
- Techniques de transcription reverse ADN complémentaire, PCR et qPCR visant des gènes fonctionnels.
- Identification in situ des bactéries par fluorescent in situ hybridization (FISH).
- Nouvelle approche Stable-Isotope Probing (SIP) pour relier la diversité et la fonction.
- Utilisation de méthodes omiques telles que metabarcoding, RNA seq, whole genome shotgun, microarray et comparaison entre méthodes.
- Étude des propriétés physico-chimiques des sols et comparaison des effets de différents traitements de sols : nitrate de calcium, paille, engrais vert, fumier, boues, tourbe, sewage sludge.
- Propriétés physico-chimiques des sols : sol nu, sol cultivé, pH, total C, total N, C/N.
- Comparaison des propriétés de diverses classes de phylum dans les sols traités.
Les études ci-dessus présentent des recherches menées sur l'utilisation de méthodes omiques pour étudier les communautés microbiennes du sol. Elles comprennent l'extraction de l'ADN du sol par PCR et les analyses TRFLP ou RISA, l'étude de l'impact de diversité des plantes et des vers de terre, l'analyse des plasmides, la quantification des microorganismes par PCR quantitative et reverse transcription PCR, la transcription reverse ADN complémentaire, l'identification in situ par FISH, la nouvelle approche SIP pour relier la diversité et la fonction, et la comparaison des méthodes omiques telles que metabarcoding, RNA seq, whole genome shotgun et microarray. Les études comparent également les effets de différents traitements de sols sur les propriétés physico-chimiques et les communautés microbiennes des sols.
This quiz covers the evolution of analytical methods in OMICS, focusing on techniques and advancements from the past to the present. Topics include 1st symposium EM, 'omic era', methodological developments, and isolation techniques.
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