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Database Conventions in Bioinformatics

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Study Flashcards

18 Questions

Quel est le seul acide aminé qui peut former une liaison covalente avec un autre acide aminé, lui-même?

Cystéine (C)

Quelle est la fonction caractéristique de la tyrosine?

Fonction phénol

Quel est l'acide aminé qui possède un groupement amine primaire à caractère basique?

Lysine (K)

Quel est l'acide aminé qui possède une fonction carboxyle primaire à caractère acide?

Aspartate (D)

Quel est le pH auquel les acides aminés à chaîne latérale polaire ionisable peuvent varier leur charge?

pH 7

Quel est l'acide aminé qui possède un noyau imidazole?

Histidine (H)

Quel est le but de l'alkylation des cystéines lors du séquençage des acides aminés?

Protéger la cystéine

Quel est le principe de la chromatographie sur couche mince pour séparer les peptides?

Hydrophobie

Quel est le procesus utilisé pour détacher les peptides de la résine lors de la chromatographie en phase inverse?

Elution

Quel est le nom de la méthode utilisée pour séquencer automatiquement les peptides isolés?

Dégradation d'Edman

Quel est le résultat de la désamination de N en D et Q en E lors de l'hydrolyse acide?

Détermination de B et de Z

Quel est le code utilisé pour représenter les acides aminés?

Un code à une lettre

Quels sont les trois groupes d'acides aminés selon la polarité et la charge des chaînes latérales?

Chaîne latérale non polaire, chaîne latérale polaire, chaîne latérale cyclisée

Quel est le code à une lettre de l'acide aminé glycine?

G

Quel est l'acide aminé à chaîne latérale linéaire avec un soufre?

Méthionine

Quel est l'acide aminé à chaîne latérale avec un noyau aromatique?

Phénylalanine

Quel est l'acide aminé à chaîne latérale cyclisée sur fonction amine secondaire?

Proline

Quel est l'acide aminé qui possède un noyau indole?

Tryptophane

Study Notes

Classification des acides aminés

  • Les acides aminés sont classés en 3 groupes selon la polarité et la charge des chaînes latérales : non polaire, polaire ionisable et polaire non ionisable.

Acides aminés à chaîne latérale non polaire

  • Glycine (G) : pas de carbone asymétrique
  • Alanine (A) : chaîne latérale linéaire
  • Valine (V) : chaîne latérale linéaire
  • Leucine (L) : chaîne latérale linéaire
  • Isoleucine (I) : chaîne latérale linéaire
  • Proline (P) : chaîne latérale cyclisée sur fonction amine secondaire
  • Méthionine (M) : chaîne latérale linéaire avec un soufre
  • Tryptophane (W) : chaîne latérale avec un noyau aromatique
  • Phénylalanine (F) : chaîne latérale avec un noyau phényl

Acides aminés à chaîne latérale polaire ionisable

  • Cystéine (C) : fonction thiol, peut former une liaison covalente avec un autre acide aminé
  • Tyrosine (Y) : fonction phénol
  • Histidine (H) : noyau imidazole, 90% déprotoné
  • Lysine (K) : groupe amine primaire, caractère basique
  • Arginine (R) : groupe guanidium, caractère basique
  • Aspartate (D) : fonction carboxyle primaire, caractère acide
  • Glutamate (E) : fonction carboxyle primaire, caractère acide

This quiz covers the conventions of databases in bioinformatics, where researchers deposit amino acid sequences they've studied. It also explores the steps involved in sequencing amino acids, including separation, reduction, and alkylation.

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