Chromatin Compactization Techniques

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Qual è la tecnica che sfrutta la trasposasi N5 per studiare l'accessibilità alla cromatina?

ATAC-Seq (correct)

FAIRE-Seq

Dnase-Seq

Chip-Seq

Quale tecnica è utilizzata per immunoprecipitare proteine legate al DNA?

Chip-Exo (correct)

ATAC-Seq

FAIRE-Seq

Dnase-Seq

Che cosa viene utilizzato in FAIRE-Seq per identificare le regioni libere della cromatina?

Trasposasi N5

Endonucleasi

DNAsi

Sonicazione (correct)

Quale tecnica è utilizzata per studiare le mutazioni delle proteine istoniche?

Chip-Exo Signup and view all the answers

Che cosa viene utilizzato in Dnase-Seq per identificare le regioni libere della cromatina?

DNAsi Signup and view all the answers

Quale tecnica è utilizzata per studiare l'organizzazione 3D della cromatina?

Metodiche varie Signup and view all the answers

Qual è il nome dell'ultimo stadio evolutivo delle tecniche di studio per visualizzare le interazioni della cromatina?

ChiA-Pet Signup and view all the answers

Qual è il metodo che consente l'immuno precipitazione delle proteine legate al DNA?

ChiA-Pet Signup and view all the answers

Qual è lo scopo dell'analisi delle sequenze di DNA mediante immuno precipitazione?

analisi delle sequenze geniche regolate Signup and view all the answers

Come vengono identificate le sequenze geniche regolate dai fattori di trascrizione?

mediante l'immuno precipitazione delle proteine legate al DNA Signup and view all the answers

Quale tecnica è un'evoluzione delle tecniche 3C, 4C e 5C?

HiC Signup and view all the answers

Quale è il risultato dell'analisi delle sequenze di DNA mediante immuno precipitazione?

analisi delle sequenze geniche regolate Signup and view all the answers

Qual è il principale limite degli array nel metodo del bisolfito?

La capacità di coprire solo siti di metilazione specifici Signup and view all the answers

Quale caratteristica delle sonde utilizzate nel metodo del bisolfito è importante?

La loro capacità di riconoscere lo stesso residuo sia metilato che non metilato Signup and view all the answers

Cosa rappresenta l'asse delle x in un grafico che confronta le metodiche di studio della metilazione del DNA?

La quantità di isole CpG che possono essere coperte Signup and view all the answers

Quale metodica di studio della metilazione del DNA consente di osservare tutti i siti di metilazione del nostro genoma?

Il WGBS Signup and view all the answers

Quale è la principale differenza tra il WGBS e le altre metodiche di studio della metilazione del DNA?

La capacità di analizzare più campioni alla volta Signup and view all the answers

Quale azienda produce sonde che arrivano a coprire fino a 800.000 siti di metilazione?

ILLUMINA Signup and view all the answers

Qual è il tipo di cellule coinvolte nella formazione di aterosclerosi?

Cellule della tonaca muscolare delle arterie Signup and view all the answers

Quali molecole hanno un ruolo epigenetico sul genoma?

MicroRNA e RNA non codificante Signup and view all the answers

Quale tipo di modifiche epigenetiche riguarda la metil-adenosina dell'mRNA?

Metilazione Signup and view all the answers

Cosa può causare l'aumento delle metil-transferasi?

Ipertrofia cardiaca Signup and view all the answers

Quale tipo di patologie molto spesso si osserva la comparsa di alterazioni epigenetiche?

Patologie tumorali Signup and view all the answers

Cosa si associa spesso al silenziamento di alcuni geni?

Metilazione delle isole CpG Signup and view all the answers

Qual è lo scopo del progetto ENCODE?

Raccogliere dati sia sulla espressione genica che sulla regolazione epigenetica Signup and view all the answers

Cosa accade ai cromosomi X delle donne?

Uno dei due cromosomi X si inattiva in modo casuale Signup and view all the answers

Chi ha scoperto il meccanismo di inattivazione del cromosoma X?

Mary Lyon Signup and view all the answers

Perché si ha l'inattivazione del cromosoma X?

Per compensare il dosaggio genico XX e XY Signup and view all the answers

Cosa rappresentano i colori arancione e nero nel gatto della slide?

I due alleli del gene del colore Signup and view all the answers

Cosa possiamo dedurre dal colore del gatto nella slide?

Che è un eterozigote Signup and view all the answers