Chromatin Compactization Techniques

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Questions and Answers

Qual è la tecnica che sfrutta la trasposasi N5 per studiare l'accessibilità alla cromatina?

  • ATAC-Seq (correct)
  • FAIRE-Seq
  • Dnase-Seq
  • Chip-Seq

Quale tecnica è utilizzata per immunoprecipitare proteine legate al DNA?

  • Chip-Exo (correct)
  • ATAC-Seq
  • FAIRE-Seq
  • Dnase-Seq

Che cosa viene utilizzato in FAIRE-Seq per identificare le regioni libere della cromatina?

  • Trasposasi N5
  • Endonucleasi
  • DNAsi
  • Sonicazione (correct)

Quale tecnica è utilizzata per studiare le mutazioni delle proteine istoniche?

<p>Chip-Exo (B)</p> Signup and view all the answers

Che cosa viene utilizzato in Dnase-Seq per identificare le regioni libere della cromatina?

<p>DNAsi (C)</p> Signup and view all the answers

Quale tecnica è utilizzata per studiare l'organizzazione 3D della cromatina?

<p>Metodiche varie (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è il nome dell'ultimo stadio evolutivo delle tecniche di studio per visualizzare le interazioni della cromatina?

<p>ChiA-Pet (C)</p> Signup and view all the answers

Qual è il metodo che consente l'immuno precipitazione delle proteine legate al DNA?

<p>ChiA-Pet (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è lo scopo dell'analisi delle sequenze di DNA mediante immuno precipitazione?

<p>analisi delle sequenze geniche regolate (A)</p> Signup and view all the answers

Come vengono identificate le sequenze geniche regolate dai fattori di trascrizione?

<p>mediante l'immuno precipitazione delle proteine legate al DNA (A)</p> Signup and view all the answers

Quale tecnica è un'evoluzione delle tecniche 3C, 4C e 5C?

<p>HiC (C)</p> Signup and view all the answers

Quale è il risultato dell'analisi delle sequenze di DNA mediante immuno precipitazione?

<p>analisi delle sequenze geniche regolate (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è il principale limite degli array nel metodo del bisolfito?

<p>La capacità di coprire solo siti di metilazione specifici (C)</p> Signup and view all the answers

Quale caratteristica delle sonde utilizzate nel metodo del bisolfito è importante?

<p>La loro capacità di riconoscere lo stesso residuo sia metilato che non metilato (D)</p> Signup and view all the answers

Cosa rappresenta l'asse delle x in un grafico che confronta le metodiche di studio della metilazione del DNA?

<p>La quantità di isole CpG che possono essere coperte (D)</p> Signup and view all the answers

Quale metodica di studio della metilazione del DNA consente di osservare tutti i siti di metilazione del nostro genoma?

<p>Il WGBS (A)</p> Signup and view all the answers

Quale è la principale differenza tra il WGBS e le altre metodiche di studio della metilazione del DNA?

<p>La capacità di analizzare più campioni alla volta (B)</p> Signup and view all the answers

Quale azienda produce sonde che arrivano a coprire fino a 800.000 siti di metilazione?

<p>ILLUMINA (A)</p> Signup and view all the answers

Qual è il tipo di cellule coinvolte nella formazione di aterosclerosi?

<p>Cellule della tonaca muscolare delle arterie (C)</p> Signup and view all the answers

Quali molecole hanno un ruolo epigenetico sul genoma?

<p>MicroRNA e RNA non codificante (A)</p> Signup and view all the answers

Quale tipo di modifiche epigenetiche riguarda la metil-adenosina dell'mRNA?

<p>Metilazione (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa può causare l'aumento delle metil-transferasi?

<p>Ipertrofia cardiaca (A)</p> Signup and view all the answers

Quale tipo di patologie molto spesso si osserva la comparsa di alterazioni epigenetiche?

<p>Patologie tumorali (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa si associa spesso al silenziamento di alcuni geni?

<p>Metilazione delle isole CpG (B)</p> Signup and view all the answers

Qual è lo scopo del progetto ENCODE?

<p>Raccogliere dati sia sulla espressione genica che sulla regolazione epigenetica (A)</p> Signup and view all the answers

Cosa accade ai cromosomi X delle donne?

<p>Uno dei due cromosomi X si inattiva in modo casuale (D)</p> Signup and view all the answers

Chi ha scoperto il meccanismo di inattivazione del cromosoma X?

<p>Mary Lyon (B)</p> Signup and view all the answers

Perché si ha l'inattivazione del cromosoma X?

<p>Per compensare il dosaggio genico XX e XY (B)</p> Signup and view all the answers

Cosa rappresentano i colori arancione e nero nel gatto della slide?

<p>I due alleli del gene del colore (C)</p> Signup and view all the answers

Cosa possiamo dedurre dal colore del gatto nella slide?

<p>Che è un eterozigote (D)</p> Signup and view all the answers

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