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Questions and Answers
Welche Techniken fallen unter den Begriff OMICS?
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Wann wurde das erste Humangenom veröffentlicht?
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Welche Funktion hat das Cytochrom in der Elektronentransportkette?
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Welche Organismen wurden im Rahmen der Genomsequenzierung untersucht?
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Was wird während der ersten Hälfte des Q-Zyklus reduziert?
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Welche Art von Bakterien lebt in Symbiose mit bestimmten Pflanzen in der Erdgeschichte?
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Wie viele Protonen werden insgesamt während des Q-Zyklus nach außen abgegeben?
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Was wurde im Miller-Urey-Experiment beobachtet?
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Welche Rolle spielt die ATP-Synthase im Zusammenhang mit dem Protonengradienten?
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Welche der folgenden Disziplinen gehört nicht zu den drei Kerngebieten der Systembiologie?
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Welches Element befindet sich im Eisen-Schwefel-Protein (Rieske-Protein)?
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Was passiert, nachdem ein Elektron von Cyt c1 abfällt?
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Welche Eigenschaft beschreiben die Bakterien aus der Burkholderia-Gattung?
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Was beschreibt die Resequenzierung?
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Was wird in der zweiten Hälfte des Q-Zyklus erneut reduziert?
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Wodurch wird der Elektronenfluss in der anoxygenen Photosynthese angetrieben?
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Welche Art von Chlorophyll ist in Cyanobakterien, den meisten Algen und grünen Pflanzen zu finden?
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Welche Pigmente sind für die Lichtabsorption in Cyanobakterien und Rotalgen verantwortlich?
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Was bewirken hohe toxische Sauerstoffspezies in Bezug auf Carotinoide?
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Welche Art von Membransystemen besitzen phototrophe Mikroben, wie z.B. Cyanobakterien?
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Was bedeutet ein negatives Reaktionspotential in der anoxygenen Photosynthese?
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Was ist das Hauptenzym, das Nitrit in Nitrat oxidiert?
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Wo wird NXR in Nitrospira lokalisiert?
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Welche der folgenden Aussagen beschreibt den Prozess der Nitrifikation am besten?
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Was passiert mit den Elektronen, die während der Nitritoxidation frei werden?
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Was sind Comammox-Bakterien?
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Welche Bedeutung hat die Nitrifikation in der Abwasserbehandlung?
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Was ist die Hauptenergiequelle für anaerobe Prokaryoten?
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Welche chemische Reaktion umfasst der Haber-Bosch-Prozess?
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Wie viel von dem Stickstoffdünger, der in der industriellen Landwirtschaft verwendet wird, wird von Menschen konsumiert?
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Welches von diesen Organismen macht beide Schritte der Nitrifikation?
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Was beschreibt der Fachausdruck Metabolismus?
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Was geschieht im ersten Schritt des Katabolismus?
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Welche Rolle spielt Acetyl-CoA im Metabolismus?
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Was ist das Nettoergebnis der Glykolyse?
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Was geschieht während der oxidativen Phosphorylierung?
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Welche Aussage trifft auf die Glykolyse zu?
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Wie wird die Einschleusung von Fructose in die Glykolyse erreicht?
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Welches Produkt entsteht als Ergebnis des Elektronentransportkette?
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Welche der folgenden Funktionen hat das glatte endoplasmatische Retikulum (ER)?
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Was ist eine Funktion der Lysosomen?
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Welches Organell ist nicht Bestandteil des Endomembransystems?
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Was wird im Golgi-Apparat nicht durchgeführt?
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Welche Struktur spielt eine wichtige Rolle in der Regulation biochemischer Aktivitäten innerhalb der Zelle?
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Welche Aussage über Peroxisomen ist korrekt?
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Was ist eine Hauptfunktion der Chloroplasten?
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Welche Struktur ist für den Transport von Proteinen in der Zelle verantwortlich?
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Welches Element ist ein Bestandteil des Mikrotubuli im Cytoskelett?
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Welches der folgenden Organe hat die Aufgabe, Fettsäuren in kleinere Moleküle zu zerlegen?
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Study Notes
Vorlesung 1
- Die frühe Erde: Entstehung aus Staub- und Gaswolke, Abkühlung Erde, Kondensation Wasserdampf
- Ursprung des Wassers: Vulkanische Ausgasungen, Kometen- und Asteroidenkollisionen
- Erste Hinweise auf mikrobielles Leben: Ausfällungen im Zusammenhang mit Meeresboden, hydrothermalen Quellen (3,770-4,280 Mio. Jahre)
- Stromatolithen: Versteinerte mikrobielle Matten, aus Schichten prokaryotischer Filamenten
- Moderne mikrobielle Matten: Querschnitt zeigt grüne Schicht mit photosynthetischen Zellen (Synechococcus)
- Moderne Stromatolithen: Hypersaline Seen & Meereslagunen, extreme Bedingungen verhindern Beweidung
Vorlesung 2
- Kultivierung von Bakterien: Nährmedium, exponentielles Wachstum, Koloniebildung
- Mikrobielle Energiestoffwechselarten: Chemotroph (an-/organische Substanze) und Phototroph (Licht als Energiequelle)
- Chemotroph: Chemolithotroph (anorganische Substanzen) und Chemoorganotroph (organische Substanzen), Mixotroph
- Phototroph: Photoautotroph (CO2) und Photoheterotroph (organische Substanzen)
- Mikrobielle Häufigkeit: Ein Gramm Erde > 1 Milliarde Zellen, >100.000 Spezies
- Verborgene Kräfte von Mikroben: Sanierung, Energieerzeugung, Stoffumwandlungen, Globale Gesundheit
- Bakterien im Menschen: Vielzahl von Arten im Darm, Einfluss auf Immunsystem, Einfluss auf Krankheitsrisiken
Vorlesung 3
- Standard-Wasserstoffelektrode (SHE): Normierung auf Ionenaktivität 1 mol/l und Wasserstoffdruck 1013 hPa
- Redox-Turm: Maß für das Reduktionspotential von Redoxpaaren (Standardbedingungen,pH 7)
- Elektronenfluss (anoxygene Photosynthese): Nur ein Photosystem, zyklische Photophosphorylierung,
- Oxidationen/Reduktionen: Reduktion (Gewinn von Elektronen) vs. Oxidation (Verlust von Elektronen)
- Coenzym Q: Elektronenübertrager in der anoxygenen Photosynthese ( drei unterschiedliche Oxidationszustände)
- Cytochrom: Proteine die Elektronen transportieren, in verschiedenen Komplexen zur Energiegewinnung
Vorlesung 4
- Ursprung des zellulären Lebens: Semipermeable FeS Membranstrukturen zur Reduktion und pH-Gradienten,
- RNA-Lebenhypothese: Sich selbst replizierende RNAs, katalytisch und informativ
- Sieben Wege der Autotrophen CO2-Fixierung: Der Calvin-Zyklus, Reverse Citric Acid Cycle
- Photosynthese & Atmung: Zusammenspiel von Energiegewinnung und Energieverbrauch in Pflanzen
- Archaeen: Nicht photosynthetisch, aber Nutzung von Lichtenergie mittels Bakterienrhodopsinen möglich
- Lichtbetriebene ATP-Erzeugung: Durch Bakterienrhodopsine (Archaeen), Energiegewinnung mithilfe von Licht
- Organismenarten: Phototroph (Lichtquelle), Chemolithotroph (Anorganische Quellen) vs. Chemoorganotroph (Organische Quellen).
Vorlesung 5
- Urease: Enzyme, das Harnstoff in Ammoniak und Kohlenstoffdioxid spaltet
- Aerobe Wasserstoffoxidation: Knallgasreaktion, Energiegewinnung durch Oxidation von Wasserstoff, Hydrogenase
- Oxidation von reduziertem Schwefel: Umwandlung von H2S etc. zu Schwefel oder Sulfat
- 3 Wege zur Sulfidoxidation: Zwei Sulfidoxidationswege mit Sulfit als Zwischenprodukt, ein Weg ohne Sulfit.
- Kabelbakt.: Elektronentransport über lange Entfernungen, Symbionten mit Bakterien, die Schwefelwasserstoff oxidieren
- Eisenoxidation: Chemolithotrophe, Energiegewinnung durch Oxidation von Eisen
Vorlesung 6
- Nitrifikation: Ammonium-Oxidation zu Nitrit, Nitrit-Oxidation zu Nitrat, wichtige Rolle in Kläranlagen
- Commamox Bakterien: Nitrifikation in einem Lebewesen (Ammonium -> Nitrat)
- Anaerobe Lebensweise: Anaerobe Atmung wichtig in Abwesenheit von Sauerstoff
- Nitratreduktion: Assimilatorisch / Dissimilatorisch (Energiegewinnung)
- Anammox: Anaerobe Oxidation von Ammonium via Anammoxosome (Vermeidung von schädlichen Zwischenprodukten)
Vorlesung 7
- Sulfatreduktion: Reduktion von Sulfat zu Sulfid, mit organischen/anorganischen Substraten oder/und H2S als
- Acetogene Organismen / Wasserstoffatmung: Nutzen CO2 als Elektronenakzeptor, spezialisierte biochemischen Reaktionen
- Methanogene Bakterien: Methanproduktion aus CO2/Acetat/H2, wichtiger Schritt im anaeroben Abbau
- Methanogenese: Biosynthese von Methan aus CO2, Acetat, oder methylierten Verbindungen, anaerobe Atmung, wichtig in
- Schlüsselcoenzyme der Methanogenese: Tetrahydromethanopterin (MP), Methanofuran (MF), Coenzym M
Vorlesung 8
- Systembiologie: Von Genomik zur Physiologie
- Vom Molekül zur Anthropologie:
- Erwin Schroedinger: Verantwortung für die Gesetze der Physik für Verständnis des Lebendigen
- Entropie: Mas für die Unordnung
- Ludwig von Bertalanffy: Offene Systeme und Gleichgewichtszustand in der Lebenswissenschaft
Vorlesung 9
- Endomembransystem: Zellkern, glattes & raues ER, Golgi-Apparat, Lysosomen, Vakuolen, Endosomen
- Ribosomen: Proteinbiosynthese im Cytosol und an rauen ER
- Zellkernhülle: Doppelmembran mit Poren für Transport, enthält Chromatin
- Chromosomen/Nucleolus: Strukturen im Zellkern
- Mikrofilamente/Mikrotubuli: Organisation des Cytoskeletts
Vorlesung 10
- Zellwand-Biosynthese: Cellulose (beta-1,4-Bindung), Stärke (alpha-1,4-Bindung), Glykogen (tierische Zellen, alpha-1,6- und alpha-1,4-Bindung).
- Struktur der Zellwand: Cellulosemikrofibrillen, Crosslinks durch Xyloglucan und Arabinogalactan
- Zellwandproteine: Extensine, Glycinreiche Proteine, Prolinreiche Proteine, arabinose/galactose-reiche Proteine
- Lipid-Biosynthese: Ablauf im Stroma der Plastide, beteiligt verschiedene Enzyme
Vorlesung 11
- Energiefluss & Recycling in Ökosystemen: Grundumsatz, Leistungsumsatz, Gesamtumsatz
- Respiratorischer Quotient (RQ): Verhältnis von ausgeatmetem CO2 zu eingeatmetem O2
- "Kleibers Gesetz": Beziehung zwischen Stoffwechselrate und Körpermasse
- Gleich- und Wechselwarme Organismen: Regulation der Körpertemperatur, Differenzierung
Vorlesung 12
- Hormone: Endokrine, parakrine, autokrine Signalübertragung
- Signalamplifikation: Beispiel adrenerger Rezeptor für Adrenalin/Noradrenalin, Aktivierung von Enzymen
- Steroidhormone: Wichtige Funktionen.
- Lipoproteine: VLDL, LDL, HDL, Transport von Lipiden im Blut
Vorlesung 13
- Zellwand-Biosynthese: Struktur der Zellwand, Aufbau und Funktion von Cellulose und Pectin
- Lipid-Biosynthese: Ablauf im Stroma der Plastide, Beteiligung verschiedener Enzyme
- Phototaxis: Lichtwahrnehmung in Chlamydomonas reinhardtii, Rhodopsin und Signalkaskade
Vorlesung 14
- Coenzym Q vs. Cytochrom: Struktur und Funktion der Moleküle, unterschiedliche Oxidationszustände
- Q-Zyklus: Detaillierte Beschreibung der Elektronentransfers, Protonentransport und Bedeutung im Redox-Gleichgewicht.
- ATP-Synthase: Aufbau und Rolle als molekularer Motor für die ATP-Synthese
- Oxidative Phosphorylierung: Zusammenspiel von Elektronenfluss, Protonengradienten und ATP-Synthese
Vorlesung 15
- Chlorosom: Struktur und Funktion des Chlorosoms in Chlorobi und Chloroflexi, Elektronentransport in Photosynthese
- Elektronenfluss in der anoxygenen Photosynthese: Fotosynthese ohne Sauerstoff-Freisetzung, zyklischer und nicht-zyklischer
- Oxidations-Reduktions-Reaktionen: Redox-Potentialwerte von verschiedenen Redoxsystemen (z.B. H2S/S0, Fe(2+)/Fe(3+)
- Reaktionszentren: Struktur und Funktion, Bespiel von Bacteriochlorophyll (BChl) und Pigmentmolekül
- Das Reaktionszentrum violetter Phototrophe: Aufbau elektronentransportkette
Vorlesung 16
- Standard-Wasserstoffelektrode (SHE): Normierung, Elektrodenpotential, Redoxsysteme, Redoxpotenziale Vergleich
- Redox-Turm: Redoxpotenziale von Redoxpaaren, chemische Gleichgewichte
- Elektronenfluss: in der anoxygenen Photosynthese
- ATP-Synthase: Aufbau, Funktion und Mechanismus.
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Description
Testen Sie Ihr Wissen über OMICS-Techniken, die Funktion von Cytochromen in der Elektronentransportkette und die Geschichte der Genomsequenzierung. Beantworten Sie Fragen zu wichtigen biologischen Konzepten und Experimenten, die das Verständnis der modernen Genetik prägten.