COPY: Bioinformática: Questões sobre BLAST e Clonagem

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Questions and Answers

Qual é a principal função do BLAST na bioinformática?

  • Armazenar dados de pesquisa biomédica.
  • Comparar sequências de DNA ou proteínas. (correct)
  • Identificar estruturas tridimensionais de proteínas.
  • Realizar clonagem de sequências nucleotídicas.

O que indica o E-value nos resultados do BLAST?

  • Percentual de identidade entre as sequências.
  • Probabilidade de um alinhamento ocorrer por acaso. (correct)
  • Pontuação total do alinhamento.
  • Cobertura da sequência de pesquisa.

Qual característica é mostrada na primeira linha do formato FASTA?

  • Um sinal > seguido pela descrição da sequência. (correct)
  • A porcentagem de identidade da sequência.
  • O nome da base de dados onde a sequência foi encontrada.
  • A sequência em formato binário.

Qual é a função do score de alinhamento nos resultados do BLAST?

<p>Avaliar a qualidade do alinhamento. (C)</p> Signup and view all the answers

O que é representado pela 'cobertura' nos resultados do BLAST?

<p>Percentual da sequência de pesquisa coberto pela sequência do hit. (B)</p> Signup and view all the answers

Quantas linhas comuns são apresentadas para cada 'hit' nos resultados do BLAST?

<p>Uma linha por cada sequência que mostra similaridade. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual é a importância do NCBI na pesquisa biomédica?

<p>Ser um dos maiores repositórios de informações biológicas. (C)</p> Signup and view all the answers

Em que formato a sequência é apresentada para reconhecimento em programas de bioinformática?

<p>Formato FASTA. (B)</p> Signup and view all the answers

Qual é o objetivo principal da clonagem molecular?

<p>Amplificar seletivamente um gene ou segmento de DNA (C)</p> Signup and view all the answers

Qual descoberta foi fundamental para viabilizar a clonagem molecular?

<p>A utilização de enzimas de restrição e ligase (C)</p> Signup and view all the answers

Qual foi uma das primeiras aplicações da clonagem molecular na medicina?

<p>Produção de insulina humana (B)</p> Signup and view all the answers

Quais são as vantagens da utilização de proteínas recombinantes em comparação com proteínas purificadas do tecido original?

<p>Produção em larga escala com controle total do processo (C)</p> Signup and view all the answers

O que caracteriza a clonagem terapêutica?

<p>Criação de células-tronco para tratamentos médicos (C)</p> Signup and view all the answers

Qual é uma das limitações comuns da clonagem molecular?

<p>Dificuldade em controlar a quantidade de proteína produzida (C)</p> Signup and view all the answers

Qual é a função dos traços horizontais em um alinhamento de sequências?

<p>Representar gaps na sequência (C)</p> Signup and view all the answers

Qual bactéria foi utilizada nos experimentos que levaram à descoberta do efeito transformante?

<p>Streptococcus pneumoniae (A)</p> Signup and view all the answers

Qual é o comprimento mínimo recomendado para um primer?

<p>15 bases (A)</p> Signup and view all the answers

Na clonagem molecular, o que são vetores de clonagem?

<p>Estruturas que transportam fragmentos de DNA para as células hospedeiras (B)</p> Signup and view all the answers

O que ocorre quando a temperatura de anelamento (Tanneal) é muito baixa?

<p>Menor estringência no anelamento (C)</p> Signup and view all the answers

Qual é a consequência de primers que podem parear com eles mesmos ou entre si?

<p>A eficiência do PCR é reduzida. (D)</p> Signup and view all the answers

Qual é a faixa ideal de % GC para a composição de um primer?

<p>40 a 60% (A)</p> Signup and view all the answers

Por que é importante que a sequência dos primers seja única na sequência do DNA molde?

<p>Para evitar a ligação com outras sequências. (A)</p> Signup and view all the answers

A temperatura de melting (Tm) é definida como?

<p>Temperatura onde metade do DNA está em forma de fita simples (B)</p> Signup and view all the answers

O que um sinal positivo (+) no alinhamento indica?

<p>Uma substituição com escore positivo (D)</p> Signup and view all the answers

Qual é o primeiro passo nas etapas da clonagem?

<p>Selecionar o modelo do estudo. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual ferramenta pode ser utilizada para traduzir sequências de pares de base em aminoácidos?

<p>Expasy Translate. (C)</p> Signup and view all the answers

Qual é a temperatura de anelamento (Tanneal) recomendada para primers com Tm de 70°C?

<p>66°C (B)</p> Signup and view all the answers

Qual é uma característica desejada ao selecionar enzimas de restrição?

<p>Não devem clivar a sequência da proteína clonada. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual é o efeito de uma temperatura de anelamento muito alta na especificidade do primer?

<p>Melhora a especificidade no emparelhamento (A)</p> Signup and view all the answers

Qual gene foi selecionado como alvo no modelo de estudo do Schistosoma mansoni?

<p>Gene ORAI. (C)</p> Signup and view all the answers

O que deve ser verificado antes de amplificar uma sequência de interesse por PCR?

<p>O quadro de leitura do vetor + inserto. (B)</p> Signup and view all the answers

Qual é a fonte de DNA molde sugerida para a amplificação da sequência de interesse por PCR?

<p>DNA genômico. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual é a função do IPTG no contexto do operon lac?

<p>Induzir a expressão da β-galactosidase (B)</p> Signup and view all the answers

Como as colônias brancas e azuis ajudam na seleção de clones recombinantes?

<p>Colônias azuis indicam a presença de β-galactosidase, enquanto brancas indicam a ausência. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual técnica é usada para confirmar que o DNA do inserto está presente no plasmídeo?

<p>PCR de colônia (C)</p> Signup and view all the answers

Qual é o resultado esperado quando uma bactéria contém um plasmídeo sem inserto?

<p>Crescimento de colônias azuis (B)</p> Signup and view all the answers

Qual é um dos métodos de identificação de clones recombinantes?

<p>Análise do padrão de restrição (B)</p> Signup and view all the answers

Para que serve o X-gal no processo de seleção de colônias?

<p>É um substrato que, quando degradado, resulta em colônias coloridas (C)</p> Signup and view all the answers

O que pode ocorrer durante a reação de PCR, além da amplificação do DNA?

<p>Introdução de mutações no DNA amplificado (B)</p> Signup and view all the answers

Qual é a função principal da β-galactosidase?

<p>Degradar polissacarídeos para açúcares simples (D)</p> Signup and view all the answers

Qual é a função dos genes repórter mencionados?

<p>Produzem uma proteína que pode ser quantificada e detectada. (B)</p> Signup and view all the answers

Qual tag é utilizada para purificação em cromatografia de afinidade?

<p>His6 (A), proteína de ligação a maltose (D)</p> Signup and view all the answers

Qual é um exemplo de como um ratinho transgénico pode ser utilizado na pesquisa?

<p>Para fluorescer quando iluminado com luz UV. (D)</p> Signup and view all the answers

O que deve ser considerado ao escolher um plasmídeo para clonagem?

<p>Número de cópias e resistência ao mesmo antibiótico. (B)</p> Signup and view all the answers

Qual é um dos passos fundamentais no processo de clonagem mencionado?

<p>Preparação do vetor e do inserto. (A)</p> Signup and view all the answers

Como as proteínas com tag são tipicamente purificadas?

<p>Cromatografia de afinidade. (A)</p> Signup and view all the answers

O que se deve garantir ao usar plasmídeos cotransformados?

<p>Que não compartilhem a mesma origem de replicação. (A)</p> Signup and view all the answers

Qual é a função do promotor na clonagem?

<p>Controlar a expressão do gene em um organismo hospedeiro. (A)</p> Signup and view all the answers

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