COPY: Bioinformática: Questões sobre BLAST e Clonagem

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Qual é a principal função do BLAST na bioinformática?

Armazenar dados de pesquisa biomédica.

Comparar sequências de DNA ou proteínas. (correct)

Identificar estruturas tridimensionais de proteínas.

Realizar clonagem de sequências nucleotídicas.

O que indica o E-value nos resultados do BLAST?

Percentual de identidade entre as sequências.

Probabilidade de um alinhamento ocorrer por acaso. (correct)

Pontuação total do alinhamento.

Cobertura da sequência de pesquisa.

Qual característica é mostrada na primeira linha do formato FASTA?

Um sinal > seguido pela descrição da sequência. (correct)

A porcentagem de identidade da sequência.

O nome da base de dados onde a sequência foi encontrada.

A sequência em formato binário.

Qual é a função do score de alinhamento nos resultados do BLAST?

Avaliar a qualidade do alinhamento. Signup and view all the answers

O que é representado pela 'cobertura' nos resultados do BLAST?

Percentual da sequência de pesquisa coberto pela sequência do hit. Signup and view all the answers

Quantas linhas comuns são apresentadas para cada 'hit' nos resultados do BLAST?

Uma linha por cada sequência que mostra similaridade. Signup and view all the answers

Qual é a importância do NCBI na pesquisa biomédica?

Ser um dos maiores repositórios de informações biológicas. Signup and view all the answers

Em que formato a sequência é apresentada para reconhecimento em programas de bioinformática?

Formato FASTA. Signup and view all the answers

Qual é o objetivo principal da clonagem molecular?

Amplificar seletivamente um gene ou segmento de DNA Signup and view all the answers

Qual descoberta foi fundamental para viabilizar a clonagem molecular?

A utilização de enzimas de restrição e ligase Signup and view all the answers

Qual foi uma das primeiras aplicações da clonagem molecular na medicina?

Produção de insulina humana Signup and view all the answers

Quais são as vantagens da utilização de proteínas recombinantes em comparação com proteínas purificadas do tecido original?

Produção em larga escala com controle total do processo Signup and view all the answers

O que caracteriza a clonagem terapêutica?

Criação de células-tronco para tratamentos médicos Signup and view all the answers

Qual é uma das limitações comuns da clonagem molecular?

Dificuldade em controlar a quantidade de proteína produzida Signup and view all the answers

Qual é a função dos traços horizontais em um alinhamento de sequências?

Representar gaps na sequência Signup and view all the answers

Qual bactéria foi utilizada nos experimentos que levaram à descoberta do efeito transformante?

Streptococcus pneumoniae Signup and view all the answers

Qual é o comprimento mínimo recomendado para um primer?

15 bases Signup and view all the answers

Na clonagem molecular, o que são vetores de clonagem?

Estruturas que transportam fragmentos de DNA para as células hospedeiras Signup and view all the answers

O que ocorre quando a temperatura de anelamento (Tanneal) é muito baixa?

Menor estringência no anelamento Signup and view all the answers

Qual é a consequência de primers que podem parear com eles mesmos ou entre si?

A eficiência do PCR é reduzida. Signup and view all the answers

Qual é a faixa ideal de % GC para a composição de um primer?

40 a 60% Signup and view all the answers

Por que é importante que a sequência dos primers seja única na sequência do DNA molde?

Para evitar a ligação com outras sequências. Signup and view all the answers

A temperatura de melting (Tm) é definida como?

Temperatura onde metade do DNA está em forma de fita simples Signup and view all the answers

O que um sinal positivo (+) no alinhamento indica?

Uma substituição com escore positivo Signup and view all the answers

Qual é o primeiro passo nas etapas da clonagem?

Selecionar o modelo do estudo. Signup and view all the answers

Qual ferramenta pode ser utilizada para traduzir sequências de pares de base em aminoácidos?

Expasy Translate. Signup and view all the answers

Qual é a temperatura de anelamento (Tanneal) recomendada para primers com Tm de 70°C?

66°C Signup and view all the answers

Qual é uma característica desejada ao selecionar enzimas de restrição?

Não devem clivar a sequência da proteína clonada. Signup and view all the answers

Qual é o efeito de uma temperatura de anelamento muito alta na especificidade do primer?

Melhora a especificidade no emparelhamento Signup and view all the answers

Qual gene foi selecionado como alvo no modelo de estudo do Schistosoma mansoni?

Gene ORAI. Signup and view all the answers

O que deve ser verificado antes de amplificar uma sequência de interesse por PCR?

O quadro de leitura do vetor + inserto. Signup and view all the answers

Qual é a fonte de DNA molde sugerida para a amplificação da sequência de interesse por PCR?

DNA genômico. Signup and view all the answers

Qual é a função do IPTG no contexto do operon lac?

Induzir a expressão da β-galactosidase Signup and view all the answers

Como as colônias brancas e azuis ajudam na seleção de clones recombinantes?

Colônias azuis indicam a presença de β-galactosidase, enquanto brancas indicam a ausência. Signup and view all the answers

Qual técnica é usada para confirmar que o DNA do inserto está presente no plasmídeo?

PCR de colônia Signup and view all the answers

Qual é o resultado esperado quando uma bactéria contém um plasmídeo sem inserto?

Crescimento de colônias azuis Signup and view all the answers

Qual é um dos métodos de identificação de clones recombinantes?

Análise do padrão de restrição Signup and view all the answers

Para que serve o X-gal no processo de seleção de colônias?

É um substrato que, quando degradado, resulta em colônias coloridas Signup and view all the answers

O que pode ocorrer durante a reação de PCR, além da amplificação do DNA?

Introdução de mutações no DNA amplificado Signup and view all the answers

Qual é a função principal da β-galactosidase?

Degradar polissacarídeos para açúcares simples Signup and view all the answers

Qual é a função dos genes repórter mencionados?

Produzem uma proteína que pode ser quantificada e detectada. Signup and view all the answers

Qual tag é utilizada para purificação em cromatografia de afinidade?

His6 Signup and view all the answers

Qual é um exemplo de como um ratinho transgénico pode ser utilizado na pesquisa?

Para fluorescer quando iluminado com luz UV. Signup and view all the answers

O que deve ser considerado ao escolher um plasmídeo para clonagem?

Número de cópias e resistência ao mesmo antibiótico. Signup and view all the answers

Qual é um dos passos fundamentais no processo de clonagem mencionado?

Preparação do vetor e do inserto. Signup and view all the answers

Como as proteínas com tag são tipicamente purificadas?

Cromatografia de afinidade. Signup and view all the answers

O que se deve garantir ao usar plasmídeos cotransformados?

Que não compartilhem a mesma origem de replicação. Signup and view all the answers

Qual é a função do promotor na clonagem?

Controlar a expressão do gene em um organismo hospedeiro. Signup and view all the answers