Base de données de structures 3D pour la modélisation moléculaire

La modélisation par homologie est une méthode utilisée pour prédire la structure tridimensionnelle d'une protéine en se basant sur la similarité avec une protéine dont la structure est déjà connue. Son principal objectif est de combler le manque de structures expérimentales pour les protéines.

La liaison peptidique -CO-NH- est responsable de la formation du squelette carboné et de la structure primaire des protéines.

La liaison peptidique -CO-NH- est une liaison amide formée entre la fonction α carboxylique d'un acide aminé et la fonction α aminée d'un autre acide aminé, tandis que la liaison carbone-carbone -CH-CO joue un rôle dans la formation du squelette mais n'est pas directement impliquée dans la structure primaire des protéines.

<p>SWISS-MODEL est un web-serveur automatisé pour la modélisation par homologie qui existe depuis 20 ans. Sa dernière version, SWISS-MODEL Workspace (2014), est conçue pour être accessible aux non-experts en bioinformatique, et son automatisation permet une meilleure reproductibilité des résultats.</p> Signup and view all the answers

<p>Le texte mentionne la base de données BLAST avec plus de 20 millions de séquences de protéines, ainsi que la base de données PDB avec 60091 structures 3D de protéines (chiffres datant de 29/09/2012).</p> Signup and view all the answers

<p>L'interaction moléculaire fait référence à la manière dont les molécules interagissent les unes avec les autres. Selon le texte, les principales composantes de l'interaction moléculaire sont l'ADN, les protéines, la transcription, la traduction, et les différents '-omes' tels que le protéome, le transcriptome et le métabolome.</p> Signup and view all the answers

<p>Le protéome fait référence à l'ensemble des protéines exprimées dans une cellule, le transcriptome représente l'ensemble des ARNm présents dans une cellule, et le métabolome englobe l'ensemble des métabolites présents dans une cellule. Ces termes sont utilisés pour décrire différents niveaux d'expression et de régulation génétique dans la cellule eucaryote.</p> Signup and view all the answers

<p>Les principales étapes du processus de l'expression génétique mentionnées dans le texte sont la transcription, la traduction, et la régulation au niveau des différents '-omes' tels que le protéome, le transcriptome et le métabolome.</p> Signup and view all the answers

<p>L'ADN est composé de séquences nucléotidiques et est lié à la protéine par le biais de la transcription et de la traduction. L'ADN joue un rôle clé dans la synthèse des protéines et dans la régulation génétique.</p> Signup and view all the answers

<p>Dans le contexte de l'interaction moléculaire, le texte mentionne la disponibilité de données telles que les mesures, les prédictions, les connaissances sur l'ADN, les protéines, la transcription, la traduction, ainsi que les différents '-omes' tels que le protéome, le transcriptome et le métabolome.</p> Signup and view all the answers