Mutations et variabilité génétique PDF

Summary

Ce document présente des notes sur les mutations et la variabilité génétique. Il aborde les types de mutations (ponctuelles, de grande ampleur, spontanées, induites), leurs caractéristiques, et des exemples spécifiques comme les conséquences des substitutions et les insertions/délétions. Le document inclut des schémas et diagrammes.

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# Mutations et variabilité génétique - Une mutation est une modification ou un changement dans l'information génétique. - Le changement génotypique est souvent accompagné d'un changement phénotypique. - Les mutations spontanées sont généralement dues à des erreurs lors de la réplication (pendant la...

# Mutations et variabilité génétique - Une mutation est une modification ou un changement dans l'information génétique. - Le changement génotypique est souvent accompagné d'un changement phénotypique. - Les mutations spontanées sont généralement dues à des erreurs lors de la réplication (pendant la réplication de l'ADN notamment, il peut se produire des erreurs spontanées et rares modifiant la séquence nucléotidique. - Certains facteurs augmentent la fréquence des mutations.) - Les mutations induites par opposition aux mutations spontanées, sont dues à l'action d'agents mutagènes physiques ou chimiques. ## Mutations et variabilité génétique - Les mutations sont pour la plupart dues à des erreurs de réplication de l'ADN. Grâce à un système enzymatique de réparation performant, la fréquence des mutations est au final très faible. - La fréquence des mutations est liée d'une part à la taille du gène (plus sa séquence est longue plus la probabilité de mutation est grande) et, d'autre part, à l'existence dans le gène de séquences fortement mutagènes comme les points chauds; elle varie de (10-7 à 10-11). ## Diagramme représentant la réplication de l'ADN The diagram shows the replication of DNA. It has the following elements: * **Réactifs génotoxiques** * **Accidents spontanés** * **Erreurs de réplication** * **Dommages** * **Polymérases** * **Détection des dommages** * **Mutations** * **Systèmes de réparation** * **Check-point du cycle cellulaire** * **Mutants** * **ADN réparé** * **Apoptose** ## Les mutations peuvent être: - ponctuelles - de grande ampleur (étendues) - spontanées - induites ## Caractéristiques des mutations: - spontanéité (mutations spontanées) - rareté - spécificité (spécifique à un ou plusieurs caractères). - hérédité. - aléatoire. ## Différents types de mutations ### Mutations ponctuelles: - substitution: une paire de nucléotides est remplacée par une autre - Transversion: remplacement d'une base purique par une base pyrimidique ou vice-versa. - Transition: Remplacement d'une base purique par une base de la même catégorie. - Diagramme: - A - G - T - C - A - G - T - C ### Mutation par réversion: - Réversion vraie. - Réversion équivalente. - Les mutations sont difficilement lisibles. Elles ne le sont que lorsque l'altération est détectable. - Le passage du type sauvage vers la forme mutante peut être direct. Une seconde mutation inverse restaure le phénotype sauvage. - Une mutation reverse est donc une succession de deux mutations (GAG (glu) GTG (val) GAG) ## L'activité de l'ADN polymérase peut donc entraîner des erreurs de réplication (mésappariements) avec mise en place d'un nucléotide incorrect (1). - Cela entraîne une mutation lors de la réplication suivante (2) qui sera ensuite reproduite (3) au cours des cycles cellulaires successifs. ## Diagramme représentant une mutation de l'ADN - **The diagram depicts a mutation of a DNA sequence, which is shown as follows:** - Stage 1: There is a correct nucleotide sequence, with the "A" being different colour than other nucleotides. This stage is labeled as "1". - Stage 2: The "A" from the initial stage changed colour, which represent a mutation. This stage is labeled as "2". - Stage 3: The mutation in the sequence is replicated, resulting in two identical mutation sequences. The stage is labeled "3". This process shows the mutation is copied down with the DNA sequence. ## Exemple: Désamination d' unescytosine méthylée en thymine - Cette mutation ponctuelle non reconnue par les systèmes de réparation est fixée à la génératio suivante. ## Différents types de mutations - délétion (délétion/udélétion): une paire de nucléotides ou(plus) est ajoutée (addition) dans la séquence d'ADN. - insertion (insertion/pinsertion): perte ou suppressiond'une paire de nucléotides (ou plus) dans la séquence d'ADN ## Les mutations silencieuses: - Provoquent un changement génotypique mais pas de changement phénotypique(GAA GAG (glu glu)) ## Les mutation faux-sens: - Changements génotypiques et phénotypiques(GAG (glu) GTG (val)) ## Les mutation non-sens: - Changement génotypique. - Aucun phénotype (Substitution provoquant l'apparition d'un des trois codons stop: UAA, UAG, UGA. Ce qui provoque l'arrêt de la traduction. (CAA (glu) TAA (stop)) ## Conséquence des substitutions - Mutation de type « faux-sens >>; le codon muté code pour un autre acide aminé - La modification d'acide-aminé au niveau de la protéine peux être tolérée par la cellule sans conséquence délétère, ce qui explique que de nombreuses variations de séquence de type << faux-sens » n'ont pas d'effet pathogène. - Mais en fonction de la localisation de l'acide-aminé touché, les mutations faux-sens peuvent avoir des effets délétères (altération du repliement protéique, de la stabilité protéique, de domaines fonctionnels, de sites d'interaction avec d'autres protéines, etc.), conduisant à la perte de fonction ou gain de fonction. ## Les insertions et/ou délétions de non-multiples de trois nucleotides: - responsables d'un décalage du cadre de lecture (FRAME-SHIFT), qui entraînera la survenue prématurée d'un codon stop. - L'effet délétère sera donc semblable à l'effet des mutations non-sens: synthèse d'une protéine tronquée, qui sera instable et dégradée (effet perte de fonction), ou avec un effet dominant négatif (effet gain de fonction)*. - Il y a donc un retentissement fonctionnel sévère expliquant que ce type de mutation est généralement pathogène. ## Diagramme représentant une mutation de séquence d'ADN - **The diagram depicts two sequences of DNA. It represents a mutation in sequence with the following elements:** - **Reference (sequence without mutation)** - 5'...ATGAGGTCCCO AACGGCCTCATTGAGAATTAGCG...3' - 5'...ATG AGG TCC CGA ACG GCC TCA TTG AGA ATT AGC G...3' - M R S R T A S L R I - **Mutant (sequence with mutation)** - 5'...ATGAGGTCCCAACGGCCTCATTGAGAATTAGCG...3' - 5'...ATG AGG TCC CAA CGG CCT CAT TGA GAA TTA GCG...3' - M R S Q R P H Stop ## Les agents mutagènes augmentent la fréquence des mutations ### Les agents mutagènes chimiques - Les analogues de bases (ex: bromo-uracile) - Les agents désaminants (ex: acide nitreux) - Les agents alkylants (nitrosoguanidine) - Les agents intercalants (bromure d'ethidium)

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