Activité 2 - Mesurer la Biodiversité Spécifique PDF

**ACTIVITÉ 2 - MESURER LA RICHESSE SPÉCIFIQUE** **[Objectif :]** Recenser, extraire et organiser des informations et utiliser une base de données moléculaire afin de comprendre les méthodes de quantification de la richesse spécifique. +--------------------------------------------------------------...

**ACTIVITÉ 2 - MESURER LA RICHESSE SPÉCIFIQUE** **[Objectif :]** Recenser, extraire et organiser des informations et utiliser une base de données moléculaire afin de comprendre les méthodes de quantification de la richesse spécifique. +-----------------------------------------------------------------------+ | **Questions** | +=======================================================================+ | 1. | | | | - - | | | | 2. 3. | +-----------------------------------------------------------------------+ **[Document 1 :] Un exemple de l'utilisation de différentes techniques pour mesurer la biodiversité des requins en Nouvelle-Calédonie.** N = échantillons prélevés ou observations réalisées E = nombre d'espèces détectées ADNe = analyse de l'ADN de l'environnement grâce au barcoding moléculaire (voir document 2)  **[Document 2 :] Une technique puissante de mesure de la biodiversité : la métagénomique** Le barcoding moléculaire consiste à identifier une espèce en comparant une courte séquence de toutes les séquences connues d'ADN rassemblées dans une banque de données, comme si l'on "scannait" son code-barre génétique. En comparant toutes les séquences d'ADN retrouvées dans un échantillon d'eau ou de sol à cette banque de données, les chercheurs peuvent identifier les espèces qui se trouvent dans cet échantillon : c'est le metabarcoding. Ces méthodes sont cependant coûteuses et ne peuvent pas remplacer complètement les reconnaissances sur le terrain, certaines espèces laissant peu de traces dans le milieu (espèces aériennes par exemple). **[Document 3 :]** **Protocole pour déterminer les espèces présentes dans un échantillon après séquençage de celui-ci.** De 2009 à 2013, les équipes de recherche à bord du Tara ont réalisé une étude approfondie par metabarcoding de la diversité des microorganismes marins. Dans une station de l'océan Indien, après séquençage de l'ADN présent dans l'eau retrouvée, ils ont obtenu entre autres 4 séquences d'ADN dont vous disposez. Afin de savoir à quelle espèce appartient chacune des séquences : +-----------------------------------------------------------------------+ | **Protocole :** | | | | - - - - - - | +-----------------------------------------------------------------------+ → Fichier de séquences identifiées dans l'eau de l'océan Indien : - - -